58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5500 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5500  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.599586  normal  0.0270035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  41.94 
 
 		 170 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  41.56 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  47.37 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  42.11 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  41.98 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  35.06 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 168 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  34.15 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  25.25 
 
 		 168 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 174 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>