More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3450 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  310  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  74.82 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  68.75 
 
 		 147 aa  206  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 164 aa  143  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  46.23 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30.83 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.86 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.86 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 172 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  34.68 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  37.23 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  36.79 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  36.14 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.82 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  33.73 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>