167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4459 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 162 aa  338  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  64.2 
 
 		 191 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  66.46 
 
 		 169 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  65.22 
 
 		 169 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  66.46 
 
 		 169 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  62.35 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  65.84 
 
 		 167 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  61.11 
 
 		 189 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  61.11 
 
 		 189 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  63.35 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  60.26 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  65.22 
 
 		 193 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  61.73 
 
 		 189 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  58.23 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  49.69 
 
 		 171 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  54.43 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  49.38 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  51.27 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  51.27 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  50.63 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  50.63 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  53.73 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  43.12 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  42.5 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  39.88 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.56 
 
 		 338 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  36.65 
 
 		 177 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  33.71 
 
 		 195 aa  90.9  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  30.81 
 
 		 203 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  32.5 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  26.85 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4072  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.232011 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  34.12 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0826  putative acetyltransferase  31.93 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  33.8 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  31.76 
 
 		 533 aa  57.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.37 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  30.54 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.49 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  30.54 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3788  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  29.5 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  37.84 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  28.92 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  28.31 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  30 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 349 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 347 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.88 
 
 		 349 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2852  GCN5-related protein N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.586337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  27.88 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.87 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.42 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  40.79 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 243 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>