87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2533 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
191 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  92.67 
 
 
191 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  80.42 
 
 
189 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  80.42 
 
 
189 aa  317  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  79.78 
 
 
183 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  78.84 
 
 
189 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  78.44 
 
 
169 aa  277  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  78.44 
 
 
169 aa  276  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  76.05 
 
 
169 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  79.63 
 
 
167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  76.05 
 
 
169 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  76.05 
 
 
193 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  64.2 
 
 
162 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  56.44 
 
 
173 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  54.43 
 
 
160 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  53.8 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 
171 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  45.24 
 
 
174 aa  157  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  48.1 
 
 
160 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  49.37 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
162 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 
163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  50.75 
 
 
139 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
163 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  42.33 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  43.56 
 
 
164 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  44.94 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  38.75 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  38.75 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 
161 aa  121  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
162 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  37.89 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.33 
 
 
174 aa  99  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  36 
 
 
195 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.66 
 
 
338 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
161 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  33.1 
 
 
160 aa  87.8  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
168 aa  85.1  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  39.39 
 
 
533 aa  71.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  26.67 
 
 
240 aa  59.3  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  31.33 
 
 
162 aa  58.9  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  25.93 
 
 
310 aa  58.2  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
153 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  25.9 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  29.79 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
153 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  23.49 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.03 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
195 aa  45.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  28.26 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  26.88 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2983  acetyltransferase, GNAT family  29.86 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.21 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1861  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2657  acetyltransferase  29.86 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.595314  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1139  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.48 
 
 
155 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2975  acetyltransferase  29.17 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0715346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
172 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
158 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  25.17 
 
 
170 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.36 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
161 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3788  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.304718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>