98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3274 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  96.83 
 
 
189 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  97.81 
 
 
183 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  92.59 
 
 
189 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  78.84 
 
 
191 aa  314  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  78.84 
 
 
191 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  73.81 
 
 
169 aa  263  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  73.81 
 
 
169 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  73.21 
 
 
169 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  75 
 
 
167 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  73.21 
 
 
169 aa  260  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  74.4 
 
 
193 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  61.73 
 
 
162 aa  217  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  57.41 
 
 
173 aa  191  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  46.63 
 
 
171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  45.73 
 
 
174 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  48.73 
 
 
160 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
160 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  49.37 
 
 
160 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  53.24 
 
 
162 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  44.94 
 
 
160 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  46.34 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 
163 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  50.75 
 
 
139 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  47.44 
 
 
163 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
173 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  45.57 
 
 
185 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
165 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  40 
 
 
165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  131  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  40 
 
 
165 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
165 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
162 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
162 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  38.36 
 
 
177 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.84 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  36.11 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.8 
 
 
338 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  34.86 
 
 
195 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  31.82 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
163 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  28.9 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  38.82 
 
 
533 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  27.41 
 
 
310 aa  64.3  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  36.7 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  29.05 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  28.31 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  32.2 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  48.9  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  29.36 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
172 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.03 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  28.26 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  27.86 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  27.89 
 
 
302 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.54 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  26.79 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  27.52 
 
 
312 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
310 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3788  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 
182 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0259  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  22.45 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  25.69 
 
 
950 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2383  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.147497 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06373  hypothetical protein  28.3 
 
 
184 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.99 
 
 
163 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.36 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0779  sortase  27.15 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  35.78 
 
 
157 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 
173 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2852  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.22 
 
 
181 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.586337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>