256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0018 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  353  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  54.78 
 
 
160 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  54.37 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  54.37 
 
 
160 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  50.62 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  53.75 
 
 
160 aa  170  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  54.94 
 
 
185 aa  168  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
163 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  54.94 
 
 
163 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  51.23 
 
 
174 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  51.23 
 
 
178 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 
162 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  52.76 
 
 
177 aa  151  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  54.42 
 
 
162 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  47.5 
 
 
169 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  43.79 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  46.25 
 
 
169 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  43.83 
 
 
191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 
169 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
189 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
189 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  42.33 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  50.75 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  41.67 
 
 
183 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  44.65 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
165 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  45.45 
 
 
165 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  44.72 
 
 
162 aa  131  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
173 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  42.24 
 
 
161 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40.8 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 
159 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.47 
 
 
338 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
182 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  34.38 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
166 aa  88.2  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 
168 aa  87.8  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  32.62 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  30.26 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  36 
 
 
533 aa  65.1  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  31.25 
 
 
310 aa  61.6  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
181 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
205 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.73 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  25 
 
 
240 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  53.9  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
174 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1977  acetyltransferase  29.88 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  33.55 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  25.77 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  33.1 
 
 
444 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 
165 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
172 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  29.86 
 
 
312 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0187  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.46628e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1783  acetyltransferase  31.79 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  27.72 
 
 
154 aa  50.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  28.99 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2125  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
243 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.642092  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0377  acetyltransferase  27.11 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.709528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2557  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  31.96 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
243 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2246  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.886105  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000192346  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0032  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0512  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
253 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
178 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.449601  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>