108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2061 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  97.81 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  94.18 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  96.83 
 
 		 189 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  80.42 
 
 		 191 aa  321  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  80.42 
 
 		 191 aa  317  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  74.4 
 
 		 169 aa  267  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  74.4 
 
 		 169 aa  264  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  73.81 
 
 		 169 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  73.21 
 
 		 169 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  75 
 
 		 167 aa  261  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  73.21 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  61.11 
 
 		 162 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  56.79 
 
 		 173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  46.01 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  49.37 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  44.51 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  50.63 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  50.63 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  45.57 
 
 		 160 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  52.52 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 		 163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  47.44 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  49.25 
 
 		 139 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  45.57 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  39.38 
 
 		 165 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  39.38 
 
 		 165 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  39.38 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 		 178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  39.38 
 
 		 165 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  37.74 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.67 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 		 161 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  35.42 
 
 		 160 aa  92.8  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.8 
 
 		 338 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  34.29 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  31.31 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  37.61 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  38.82 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  27.84 
 
 		 240 aa  62  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  25.19 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  29.34 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  27.11 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  28.57 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.45 
 
 		 156 aa  48.9  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  29.36 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.85 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  27.54 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  27.89 
 
 		 302 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0259  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3788  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  35.23 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2852  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.94 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.586337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  22.45 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1982  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.77 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.615427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.84 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  22.82 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  24.53 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  25 
 
 		 950 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 193 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06373  hypothetical protein  28.93 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 		 182 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1827  phosphinothricin N-acetyltransferase  25.69 
 
 		 163 aa  42  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05103  acetyltransferase  25.17 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.62 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  34.09 
 
 		 312 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  25.35 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>