More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2237 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  45.74 
 
 		 907 aa  690    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  60.09 
 
 		 903 aa  1025    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  46.15 
 
 		 976 aa  707    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  47.4 
 
 		 902 aa  717    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  45.12 
 
 		 887 aa  679    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  44.48 
 
 		 881 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  41.24 
 
 		 901 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  56.04 
 
 		 926 aa  930    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  55.53 
 
 		 902 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  46.74 
 
 		 893 aa  719    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  44.34 
 
 		 899 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 950 aa  1875    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  42.72 
 
 		 899 aa  633  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  41.27 
 
 		 894 aa  629  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  45.19 
 
 		 868 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  48.63 
 
 		 821 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  44.92 
 
 		 909 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 		 920 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  41.66 
 
 		 872 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  38.94 
 
 		 909 aa  558  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 907 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 		 926 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  37.23 
 
 		 883 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 907 aa  502  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  42.16 
 
 		 831 aa  487  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  37.85 
 
 		 934 aa  489  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 		 909 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 911 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  39.08 
 
 		 977 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.36 
 
 		 908 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 		 926 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  36.74 
 
 		 904 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 898 aa  422  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  39.84 
 
 		 707 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  39.15 
 
 		 867 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  35.84 
 
 		 887 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 		 775 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.6 
 
 		 697 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.42 
 
 		 696 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 771 aa  365  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 883 aa  364  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.06 
 
 		 698 aa  357  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.38 
 
 		 699 aa  347  8.999999999999999e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.01 
 
 		 701 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  32.14 
 
 		 852 aa  340  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 712 aa  340  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.95 
 
 		 698 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 711 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.75 
 
 		 700 aa  329  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  31.8 
 
 		 706 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.16 
 
 		 911 aa  327  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.57 
 
 		 929 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.44 
 
 		 918 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 		 696 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.21 
 
 		 697 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  29.71 
 
 		 912 aa  310  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  36.05 
 
 		 886 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 704 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.93 
 
 		 915 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  32.38 
 
 		 637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.38 
 
 		 920 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.38 
 
 		 921 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.36 
 
 		 695 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  28.81 
 
 		 905 aa  294  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.77 
 
 		 897 aa  292  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 669 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.89 
 
 		 698 aa  284  7.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.72 
 
 		 711 aa  281  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.07 
 
 		 892 aa  279  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.5 
 
 		 699 aa  278  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  29.18 
 
 		 707 aa  276  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.15 
 
 		 903 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  29.66 
 
 		 911 aa  273  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  28.31 
 
 		 697 aa  271  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.76 
 
 		 904 aa  268  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.94 
 
 		 892 aa  266  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  29.78 
 
 		 893 aa  264  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 898 aa  263  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  29.96 
 
 		 728 aa  263  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 		 889 aa  262  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  28.63 
 
 		 896 aa  262  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 900 aa  258  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  25.26 
 
 		 698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  26.68 
 
 		 895 aa  252  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.13 
 
 		 704 aa  252  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 		 893 aa  251  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 898 aa  250  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 702 aa  250  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 896 aa  250  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  26.52 
 
 		 703 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 899 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  27.81 
 
 		 900 aa  248  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 702 aa  248  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 913 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 913 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 904 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 901 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 		 905 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  28.08 
 
 		 901 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  27.57 
 
 		 898 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>