More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1913 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  100 
 
 
852 aa  1672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  47.1 
 
 
887 aa  631  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  44.86 
 
 
886 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  40.16 
 
 
911 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  37.88 
 
 
883 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  40.77 
 
 
904 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  38.77 
 
 
926 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
883 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  34.75 
 
 
926 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  35.57 
 
 
881 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  34.72 
 
 
903 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  34.17 
 
 
976 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  36.11 
 
 
899 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  35.39 
 
 
902 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  36.18 
 
 
902 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  33.82 
 
 
887 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.61 
 
 
696 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
893 aa  402  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  34.13 
 
 
907 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  31.96 
 
 
899 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  34.43 
 
 
898 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  37.66 
 
 
706 aa  396  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.93 
 
 
698 aa  389  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.84 
 
 
697 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  31.93 
 
 
894 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.21 
 
 
699 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  35.75 
 
 
704 aa  367  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  31.92 
 
 
901 aa  366  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  36.21 
 
 
698 aa  366  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  32.14 
 
 
950 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  34.09 
 
 
911 aa  359  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
872 aa  356  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  33.19 
 
 
696 aa  356  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.17 
 
 
929 aa  353  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  34.46 
 
 
893 aa  347  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
868 aa  347  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 
711 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.95 
 
 
913 aa  342  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33 
 
 
892 aa  340  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.19 
 
 
892 aa  340  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.79 
 
 
921 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  35.4 
 
 
903 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.36 
 
 
918 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.25 
 
 
712 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  35.62 
 
 
821 aa  336  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.59 
 
 
920 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.47 
 
 
915 aa  336  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  34.09 
 
 
698 aa  335  3e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
702 aa  335  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  32.21 
 
 
904 aa  333  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.81 
 
 
701 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  34.54 
 
 
920 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  33.8 
 
 
912 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.92 
 
 
711 aa  332  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.5 
 
 
702 aa  331  3e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.16 
 
 
700 aa  331  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  31.87 
 
 
907 aa  327  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.78 
 
 
900 aa  327  8.000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.96 
 
 
703 aa  326  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.17 
 
 
909 aa  325  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.6 
 
 
895 aa  323  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 
907 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  31.5 
 
 
899 aa  319  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  33.62 
 
 
897 aa  317  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  30.56 
 
 
911 aa  317  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.78 
 
 
905 aa  317  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  30.93 
 
 
903 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
698 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.13 
 
 
697 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
896 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
901 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  30.81 
 
 
901 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
775 aa  315  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  30.58 
 
 
905 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  30.67 
 
 
901 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.72 
 
 
699 aa  312  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
893 aa  313  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.26 
 
 
706 aa  312  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  30.48 
 
 
900 aa  312  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  30.95 
 
 
904 aa  312  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
909 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  30.95 
 
 
913 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 
907 aa  310  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.6 
 
 
897 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  30.95 
 
 
913 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.4 
 
 
669 aa  308  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.91 
 
 
831 aa  308  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
889 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  32.57 
 
 
911 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.57 
 
 
728 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  32.49 
 
 
899 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  32.86 
 
 
977 aa  303  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.29 
 
 
695 aa  303  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
907 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
893 aa  302  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.76 
 
 
900 aa  300  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
898 aa  299  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.03 
 
 
896 aa  298  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
897 aa  298  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
907 aa  296  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>