More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1311 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  100 
 
 
886 aa  1756    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  53.15 
 
 
887 aa  740    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  44.86 
 
 
852 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  42.74 
 
 
911 aa  579  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  42.56 
 
 
904 aa  535  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  38.14 
 
 
883 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  40.31 
 
 
926 aa  496  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  37.04 
 
 
926 aa  482  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  38 
 
 
881 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  37.03 
 
 
887 aa  477  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  36.77 
 
 
902 aa  472  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  35.54 
 
 
907 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  37.37 
 
 
898 aa  466  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  36.21 
 
 
903 aa  465  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  38.39 
 
 
883 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  33.88 
 
 
976 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
893 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  35.54 
 
 
899 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  37.51 
 
 
872 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  34.86 
 
 
950 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  35.93 
 
 
899 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
901 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
868 aa  429  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  33.56 
 
 
894 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  34.66 
 
 
902 aa  419  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  37.25 
 
 
909 aa  412  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  39.26 
 
 
821 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.05 
 
 
909 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.72 
 
 
696 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.27 
 
 
699 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.52 
 
 
697 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
920 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  37.05 
 
 
775 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.67 
 
 
698 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.08 
 
 
907 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  35.52 
 
 
698 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 
706 aa  365  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.33 
 
 
929 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
907 aa  364  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  34.49 
 
 
977 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
771 aa  357  5.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  34.03 
 
 
911 aa  356  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
909 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.81 
 
 
697 aa  351  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
701 aa  347  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.23 
 
 
712 aa  343  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.06 
 
 
711 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  30.62 
 
 
704 aa  340  8e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  37.27 
 
 
707 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  33.15 
 
 
912 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  33.63 
 
 
926 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.1 
 
 
695 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.58 
 
 
700 aa  334  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.3 
 
 
915 aa  333  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.83 
 
 
918 aa  331  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33 
 
 
831 aa  331  4e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.22 
 
 
702 aa  330  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.63 
 
 
913 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.29 
 
 
934 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.32 
 
 
892 aa  327  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
702 aa  326  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  32.41 
 
 
904 aa  324  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  30.19 
 
 
698 aa  321  3e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  30.86 
 
 
696 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
703 aa  320  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.82 
 
 
921 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.74 
 
 
897 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.24 
 
 
699 aa  317  8e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  33.1 
 
 
920 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.4 
 
 
711 aa  316  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  33.47 
 
 
907 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.22 
 
 
889 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  30.24 
 
 
908 aa  313  6.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  32.38 
 
 
698 aa  313  9e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  35.35 
 
 
897 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.07 
 
 
905 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.89 
 
 
892 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  31.32 
 
 
893 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  29.83 
 
 
669 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
897 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.15 
 
 
895 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  35.73 
 
 
893 aa  296  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.05 
 
 
727 aa  296  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 
893 aa  295  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  32.38 
 
 
867 aa  293  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.44 
 
 
900 aa  292  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.51 
 
 
903 aa  292  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  30.06 
 
 
707 aa  291  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.03 
 
 
706 aa  289  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  33.84 
 
 
903 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  34.07 
 
 
897 aa  287  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
899 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.3 
 
 
714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.3 
 
 
728 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.32 
 
 
704 aa  284  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
907 aa  284  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  31.92 
 
 
907 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  35.21 
 
 
693 aa  280  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
900 aa  277  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
896 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>