More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4844 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  73.88 
 
 
693 aa  963    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
693 aa  1373    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  45.23 
 
 
727 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  35.73 
 
 
706 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  34.56 
 
 
707 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  37.39 
 
 
911 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.18 
 
 
929 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.66 
 
 
712 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 
701 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.43 
 
 
699 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.09 
 
 
696 aa  363  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  35.89 
 
 
893 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.38 
 
 
711 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.95 
 
 
698 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.24 
 
 
697 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.19 
 
 
711 aa  349  8e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  33.52 
 
 
700 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.04 
 
 
892 aa  347  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  35.66 
 
 
883 aa  346  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  32.73 
 
 
921 aa  346  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  34.03 
 
 
704 aa  343  4e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.86 
 
 
699 aa  343  5e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
889 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 
696 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 
918 aa  339  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.86 
 
 
915 aa  336  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  33.15 
 
 
912 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.4 
 
 
660 aa  334  3e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.57 
 
 
698 aa  333  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  34.04 
 
 
920 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
893 aa  333  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.96 
 
 
706 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  35.93 
 
 
715 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32.91 
 
 
892 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.75 
 
 
897 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.87 
 
 
703 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.61 
 
 
702 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
698 aa  320  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.94 
 
 
702 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.81 
 
 
669 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  29.52 
 
 
698 aa  318  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.62 
 
 
905 aa  317  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  37.01 
 
 
904 aa  317  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  33.38 
 
 
704 aa  316  8e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  34.78 
 
 
715 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  30.25 
 
 
660 aa  311  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  36.71 
 
 
911 aa  312  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.97 
 
 
913 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  32.76 
 
 
700 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.83 
 
 
903 aa  308  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  36.8 
 
 
926 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  33 
 
 
697 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.95 
 
 
699 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.83 
 
 
712 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.06 
 
 
714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  34.18 
 
 
699 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
883 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.67 
 
 
926 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.2 
 
 
895 aa  297  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  34.99 
 
 
709 aa  296  7e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.01 
 
 
900 aa  295  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
682 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.92 
 
 
728 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.38 
 
 
695 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  36.17 
 
 
898 aa  290  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.57 
 
 
881 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  33.76 
 
 
711 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
903 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  36.73 
 
 
887 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  35.4 
 
 
886 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  33.43 
 
 
899 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  30.66 
 
 
911 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.25 
 
 
904 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  32.81 
 
 
710 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
907 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.71 
 
 
750 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
907 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
896 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
907 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
898 aa  277  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  32.12 
 
 
700 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  34.23 
 
 
718 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
893 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  34.33 
 
 
852 aa  275  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.03 
 
 
896 aa  273  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  28.87 
 
 
893 aa  273  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  29.97 
 
 
913 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  29.97 
 
 
903 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  29.83 
 
 
904 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  30.18 
 
 
911 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  29.83 
 
 
913 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.31 
 
 
708 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  29.69 
 
 
901 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
899 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
905 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
901 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.59 
 
 
900 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  29.55 
 
 
901 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  31.42 
 
 
711 aa  264  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  32.81 
 
 
703 aa  264  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>