More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3827 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  100 
 
 		 700 aa  1387    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  57.58 
 
 		 715 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  70.93 
 
 		 712 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  57.62 
 
 		 715 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 		 710 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  40.67 
 
 		 705 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  39.78 
 
 		 725 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  40.2 
 
 		 703 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  37.59 
 
 		 699 aa  399  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  37.14 
 
 		 711 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  35.67 
 
 		 700 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  36.53 
 
 		 708 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.38 
 
 		 696 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  36.36 
 
 		 711 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  37.68 
 
 		 698 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  37.34 
 
 		 704 aa  365  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.19 
 
 		 711 aa  359  8e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 669 aa  353  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.01 
 
 		 697 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  34.17 
 
 		 707 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  32.66 
 
 		 704 aa  352  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  36.76 
 
 		 712 aa  350  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  36.51 
 
 		 692 aa  347  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 706 aa  346  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.37 
 
 		 698 aa  343  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.75 
 
 		 699 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  35.46 
 
 		 718 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  35.85 
 
 		 697 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 		 700 aa  340  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.6 
 
 		 710 aa  340  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 698 aa  340  7e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  36.06 
 
 		 695 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 711 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  35.68 
 
 		 695 aa  335  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 696 aa  333  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 703 aa  332  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 702 aa  332  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.9 
 
 		 728 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.66 
 
 		 698 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  35.71 
 
 		 703 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.48 
 
 		 699 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.61 
 
 		 892 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.1 
 
 		 700 aa  326  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  35.46 
 
 		 718 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 711 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33.76 
 
 		 709 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  34.32 
 
 		 704 aa  321  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.57 
 
 		 698 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  35.79 
 
 		 699 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  34.71 
 
 		 702 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.29 
 
 		 929 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 		 893 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.52 
 
 		 715 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  34.15 
 
 		 697 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.96 
 
 		 897 aa  309  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32.45 
 
 		 892 aa  306  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.43 
 
 		 741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 701 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.7 
 
 		 895 aa  303  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 893 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 729 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 706 aa  300  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.57 
 
 		 697 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 693 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.45 
 
 		 912 aa  297  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  34.7 
 
 		 690 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.38 
 
 		 905 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.96 
 
 		 699 aa  295  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.67 
 
 		 921 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  33.57 
 
 		 705 aa  295  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 703 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.96 
 
 		 918 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  33.43 
 
 		 718 aa  293  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  31.79 
 
 		 708 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.93 
 
 		 915 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.79 
 
 		 920 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 693 aa  290  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  33.57 
 
 		 709 aa  289  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.42 
 
 		 695 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.17 
 
 		 900 aa  286  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.03 
 
 		 897 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.1 
 
 		 715 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 913 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.35 
 
 		 904 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.46 
 
 		 660 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 702 aa  283  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 898 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  33.57 
 
 		 699 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.83 
 
 		 911 aa  281  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  30.66 
 
 		 685 aa  280  9e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.24 
 
 		 903 aa  274  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  33.15 
 
 		 714 aa  272  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 716 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  30.4 
 
 		 911 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 707 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 893 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>