More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3421 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  100 
 
 
690 aa  1350    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  84.26 
 
 
702 aa  1057    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  54.14 
 
 
766 aa  695    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  45.64 
 
 
695 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  45.64 
 
 
695 aa  528  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  46.59 
 
 
697 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  42.57 
 
 
702 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  42.73 
 
 
697 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  45.43 
 
 
699 aa  485  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  36.64 
 
 
712 aa  324  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.19 
 
 
700 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
715 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  32.72 
 
 
715 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  33.33 
 
 
711 aa  290  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  31.04 
 
 
699 aa  287  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
702 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.29 
 
 
702 aa  281  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  33.14 
 
 
692 aa  280  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  30.7 
 
 
700 aa  280  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  27.66 
 
 
703 aa  278  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  34.53 
 
 
711 aa  277  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  30.3 
 
 
750 aa  276  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  30.24 
 
 
708 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.05 
 
 
718 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.56 
 
 
698 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 
727 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  32.29 
 
 
710 aa  273  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.56 
 
 
697 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
918 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.14 
 
 
696 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.25 
 
 
704 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.3 
 
 
695 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.95 
 
 
715 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 
729 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  29.51 
 
 
711 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  25.76 
 
 
706 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  33.43 
 
 
741 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.83 
 
 
725 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.79 
 
 
911 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  31.86 
 
 
698 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  32.9 
 
 
718 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.29 
 
 
929 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.59 
 
 
912 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.55 
 
 
697 aa  256  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.22 
 
 
698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  29.86 
 
 
698 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  28.09 
 
 
669 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.03 
 
 
711 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  28.59 
 
 
704 aa  249  9e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  31.5 
 
 
705 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.47 
 
 
708 aa  246  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  30.43 
 
 
715 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  33.19 
 
 
926 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  33 
 
 
703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.87 
 
 
711 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  30.59 
 
 
703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  28.72 
 
 
707 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
700 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.81 
 
 
911 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.37 
 
 
921 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  29.91 
 
 
706 aa  243  9e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.34 
 
 
895 aa  241  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  30.83 
 
 
712 aa  240  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 
699 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 
703 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  31.02 
 
 
727 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 
705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  40.05 
 
 
710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  31.05 
 
 
705 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  26.96 
 
 
712 aa  233  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  31.63 
 
 
705 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.73 
 
 
897 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.42 
 
 
699 aa  230  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
883 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  27.67 
 
 
915 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.56 
 
 
728 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  28.73 
 
 
700 aa  228  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  26.7 
 
 
701 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  28.76 
 
 
892 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  31.21 
 
 
705 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  25.28 
 
 
714 aa  223  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  31.68 
 
 
696 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.7 
 
 
892 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
899 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.8 
 
 
897 aa  221  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  32.33 
 
 
714 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  31.36 
 
 
709 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  31.54 
 
 
696 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  37.46 
 
 
516 aa  218  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 
693 aa  218  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  26.9 
 
 
696 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  27.65 
 
 
913 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  32.39 
 
 
898 aa  211  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  29.11 
 
 
893 aa  210  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  34.96 
 
 
689 aa  210  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  30.67 
 
 
684 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  26.99 
 
 
905 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  25.11 
 
 
660 aa  208  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
893 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  31.26 
 
 
907 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>