More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4596 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  100 
 
 
712 aa  1403    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  71.78 
 
 
700 aa  961    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  70.63 
 
 
704 aa  957    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  67.19 
 
 
703 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  67.58 
 
 
699 aa  861    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  74.31 
 
 
698 aa  985    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  36.59 
 
 
750 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  37.57 
 
 
715 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  36.63 
 
 
703 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  36.59 
 
 
708 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.58 
 
 
699 aa  361  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  34.09 
 
 
696 aa  360  6e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  37.82 
 
 
715 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  36.76 
 
 
715 aa  346  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  37.13 
 
 
700 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  36.36 
 
 
710 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  35.6 
 
 
711 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  35.52 
 
 
711 aa  332  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  37.38 
 
 
712 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  33.38 
 
 
920 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  34.09 
 
 
708 aa  329  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  34.77 
 
 
711 aa  328  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.33 
 
 
700 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.21 
 
 
699 aa  327  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.81 
 
 
692 aa  326  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
711 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.86 
 
 
696 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  36.49 
 
 
893 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.82 
 
 
712 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.24 
 
 
669 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
706 aa  323  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.7 
 
 
711 aa  322  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  35.12 
 
 
700 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 
701 aa  320  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  34.9 
 
 
709 aa  317  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  34.94 
 
 
705 aa  317  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  35.5 
 
 
913 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  35.66 
 
 
725 aa  313  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
918 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.14 
 
 
698 aa  313  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.98 
 
 
704 aa  312  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.72 
 
 
697 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.4 
 
 
699 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  36.43 
 
 
903 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.24 
 
 
892 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.64 
 
 
921 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.24 
 
 
707 aa  307  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.36 
 
 
702 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.53 
 
 
911 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.8 
 
 
698 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.89 
 
 
703 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  32.43 
 
 
912 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.97 
 
 
706 aa  303  7.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  31.86 
 
 
708 aa  303  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.65 
 
 
883 aa  303  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
702 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  35.81 
 
 
703 aa  300  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.23 
 
 
710 aa  298  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.04 
 
 
929 aa  296  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  34.44 
 
 
697 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  34.99 
 
 
714 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  35.7 
 
 
893 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 
915 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33 
 
 
718 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.85 
 
 
892 aa  283  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.11 
 
 
897 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  30.58 
 
 
698 aa  280  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  33.66 
 
 
911 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  32.62 
 
 
695 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  34.13 
 
 
898 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  33.15 
 
 
718 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  32.72 
 
 
695 aa  273  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.76 
 
 
697 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
926 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.08 
 
 
714 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.74 
 
 
704 aa  269  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.64 
 
 
728 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  32.15 
 
 
709 aa  268  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.17 
 
 
895 aa  267  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  30.66 
 
 
699 aa  267  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  34.92 
 
 
904 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  33.8 
 
 
741 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.66 
 
 
695 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  34.84 
 
 
716 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.61 
 
 
900 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
893 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  33.77 
 
 
729 aa  260  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.51 
 
 
697 aa  260  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
903 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  35.04 
 
 
897 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.34 
 
 
698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  33.7 
 
 
705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.44 
 
 
905 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  30.08 
 
 
705 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  31.58 
 
 
702 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  31.36 
 
 
703 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.47 
 
 
904 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  31.36 
 
 
703 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
889 aa  251  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  30.37 
 
 
685 aa  249  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>