More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1473 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  100 
 
 		 716 aa  1404    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.52 
 
 		 696 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 710 aa  334  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  34.36 
 
 		 892 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  35.35 
 
 		 741 aa  326  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  34.99 
 
 		 699 aa  323  5e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.26 
 
 		 905 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  36.16 
 
 		 725 aa  318  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 		 718 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.97 
 
 		 929 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.96 
 
 		 708 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 669 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  32.63 
 
 		 711 aa  307  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.09 
 
 		 697 aa  306  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.38 
 
 		 699 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.52 
 
 		 920 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.19 
 
 		 698 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  33.15 
 
 		 912 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 696 aa  303  9e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.92 
 
 		 892 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  33.66 
 
 		 708 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.5 
 
 		 921 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.89 
 
 		 699 aa  296  9e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.72 
 
 		 895 aa  296  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 702 aa  296  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.36 
 
 		 704 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 702 aa  294  5e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 703 aa  294  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  31.73 
 
 		 698 aa  293  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.83 
 
 		 715 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  34.74 
 
 		 712 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.91 
 
 		 897 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.87 
 
 		 911 aa  291  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  36.53 
 
 		 712 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 706 aa  290  6e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 712 aa  290  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.52 
 
 		 704 aa  290  9e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  33.52 
 
 		 718 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  34.33 
 
 		 705 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.81 
 
 		 711 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 		 918 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.47 
 
 		 692 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.86 
 
 		 703 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  32.21 
 
 		 913 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  31.91 
 
 		 700 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.59 
 
 		 698 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  29.99 
 
 		 707 aa  280  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  32.44 
 
 		 750 aa  280  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 893 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.4 
 
 		 900 aa  276  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.81 
 
 		 711 aa  276  8e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.34 
 
 		 915 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  33.99 
 
 		 698 aa  273  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  33.57 
 
 		 697 aa  271  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.08 
 
 		 728 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 698 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 711 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.19 
 
 		 715 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 		 889 aa  266  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 701 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.2 
 
 		 697 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 709 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.72 
 
 		 714 aa  265  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  31.02 
 
 		 706 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  31.25 
 
 		 709 aa  263  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  32.3 
 
 		 711 aa  262  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 		 893 aa  262  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.92 
 
 		 903 aa  260  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  31.49 
 
 		 729 aa  260  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  34.8 
 
 		 699 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  31.3 
 
 		 699 aa  258  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 903 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.77 
 
 		 695 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  29.81 
 
 		 700 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  34.45 
 
 		 715 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.77 
 
 		 890 aa  253  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  31.32 
 
 		 703 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  31.32 
 
 		 703 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  31.51 
 
 		 705 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  34.55 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.49 
 
 		 715 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  32.86 
 
 		 696 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.62 
 
 		 697 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  32.86 
 
 		 696 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 660 aa  244  3.9999999999999997e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  29.11 
 
 		 684 aa  244  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.34 
 
 		 727 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.56 
 
 		 695 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  32.87 
 
 		 705 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  33.89 
 
 		 897 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.64 
 
 		 695 aa  239  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  31.53 
 
 		 705 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  30.92 
 
 		 727 aa  237  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.59 
 
 		 702 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  30.8 
 
 		 896 aa  232  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  31.32 
 
 		 893 aa  231  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 893 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 907 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  32.86 
 
 		 699 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>