More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1759 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  71.78 
 
 		 712 aa  954    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  67.52 
 
 		 703 aa  910    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  70.94 
 
 		 704 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  79.08 
 
 		 698 aa  1044    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  67.09 
 
 		 699 aa  853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 700 aa  1371    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  40.06 
 
 		 715 aa  392  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 703 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  36.58 
 
 		 708 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  38.93 
 
 		 710 aa  352  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  35.43 
 
 		 750 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  34.79 
 
 		 699 aa  345  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  36.7 
 
 		 715 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  34.55 
 
 		 711 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  35.36 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.29 
 
 		 700 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  35.47 
 
 		 711 aa  334  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  34.46 
 
 		 708 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.76 
 
 		 696 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 705 aa  324  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.94 
 
 		 711 aa  324  4e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  35.17 
 
 		 700 aa  323  7e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.73 
 
 		 692 aa  323  8e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 712 aa  323  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  35.17 
 
 		 709 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  33.7 
 
 		 700 aa  320  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  32.72 
 
 		 701 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.82 
 
 		 707 aa  319  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.38 
 
 		 696 aa  319  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 711 aa  317  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.24 
 
 		 699 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.98 
 
 		 704 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  34.79 
 
 		 893 aa  307  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.45 
 
 		 698 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  35.33 
 
 		 725 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  32.96 
 
 		 913 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 711 aa  303  9e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 702 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.15 
 
 		 697 aa  303  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  31.16 
 
 		 708 aa  300  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 702 aa  299  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 706 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 703 aa  295  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 712 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 710 aa  292  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 669 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  34.87 
 
 		 703 aa  290  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.35 
 
 		 920 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.76 
 
 		 699 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 698 aa  287  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 706 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.94 
 
 		 695 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.34 
 
 		 903 aa  285  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.71 
 
 		 892 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  33.65 
 
 		 718 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 		 918 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 695 aa  282  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.3 
 
 		 893 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.21 
 
 		 921 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.37 
 
 		 714 aa  278  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.19 
 
 		 911 aa  274  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.89 
 
 		 929 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  33.86 
 
 		 904 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.9 
 
 		 704 aa  269  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.94 
 
 		 698 aa  269  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.33 
 
 		 883 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.29 
 
 		 897 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.52 
 
 		 915 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  31.33 
 
 		 697 aa  266  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.53 
 
 		 698 aa  266  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  29.86 
 
 		 912 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.58 
 
 		 728 aa  264  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.58 
 
 		 895 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 729 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.99 
 
 		 697 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.5 
 
 		 905 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.15 
 
 		 911 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 		 893 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  30.47 
 
 		 697 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 718 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.41 
 
 		 892 aa  256  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.62 
 
 		 897 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  31.28 
 
 		 705 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30 
 
 		 695 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  30.49 
 
 		 709 aa  253  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  32.7 
 
 		 715 aa  251  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  29.65 
 
 		 702 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  30.42 
 
 		 699 aa  250  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.37 
 
 		 900 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  33.03 
 
 		 741 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 898 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  32.48 
 
 		 699 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 898 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 707 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  32.93 
 
 		 727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 		 903 aa  240  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 897 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  32.57 
 
 		 702 aa  237  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  32.92 
 
 		 705 aa  237  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>