More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1903 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  100 
 
 
709 aa  1420    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  49.79 
 
 
718 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  40.51 
 
 
711 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  36.4 
 
 
706 aa  365  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
918 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.57 
 
 
892 aa  353  8.999999999999999e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.1 
 
 
929 aa  349  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.15 
 
 
711 aa  346  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  36.34 
 
 
710 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.57 
 
 
696 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  34.94 
 
 
920 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  33.19 
 
 
696 aa  340  5e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  32.82 
 
 
921 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  35.41 
 
 
893 aa  338  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.1 
 
 
892 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  32.82 
 
 
912 aa  333  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.16 
 
 
698 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  34.41 
 
 
711 aa  331  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.62 
 
 
697 aa  330  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.87 
 
 
905 aa  329  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.8 
 
 
911 aa  329  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.9 
 
 
708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.24 
 
 
699 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  33.75 
 
 
913 aa  327  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  33.62 
 
 
700 aa  326  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.1 
 
 
897 aa  326  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.17 
 
 
895 aa  326  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  32.19 
 
 
915 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.99 
 
 
710 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  35.32 
 
 
698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  33.48 
 
 
699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  35.6 
 
 
712 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  34.99 
 
 
700 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  32.18 
 
 
698 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.99 
 
 
707 aa  320  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  33.14 
 
 
715 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  35.77 
 
 
703 aa  319  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.42 
 
 
704 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.24 
 
 
704 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
711 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 
703 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  35.29 
 
 
897 aa  312  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
698 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  33.72 
 
 
711 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  32.55 
 
 
904 aa  310  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
703 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 
712 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.34 
 
 
903 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.1 
 
 
715 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.9 
 
 
702 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
893 aa  308  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.15 
 
 
702 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
889 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.05 
 
 
700 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.01 
 
 
669 aa  303  9e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
698 aa  300  8e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.52 
 
 
699 aa  300  8e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.75 
 
 
715 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.86 
 
 
741 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  35.07 
 
 
712 aa  297  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.6 
 
 
900 aa  296  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.16 
 
 
706 aa  296  6e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  32.52 
 
 
692 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  30.45 
 
 
700 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
701 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  33.84 
 
 
709 aa  294  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.77 
 
 
699 aa  291  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.91 
 
 
728 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.73 
 
 
714 aa  290  6e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
904 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
715 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  33.48 
 
 
697 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
890 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  33.74 
 
 
892 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  32.96 
 
 
727 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.59 
 
 
704 aa  281  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
926 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
907 aa  277  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
899 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
908 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.44 
 
 
660 aa  274  5.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
895 aa  272  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
901 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  32.97 
 
 
729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
892 aa  270  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  33.09 
 
 
705 aa  270  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  33.43 
 
 
695 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
896 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.6 
 
 
883 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
705 aa  267  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
897 aa  267  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  33.89 
 
 
918 aa  267  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  33.38 
 
 
893 aa  264  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  32.79 
 
 
898 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
907 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
897 aa  263  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 
695 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 
707 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  29.14 
 
 
911 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.12 
 
 
718 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>