More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1377 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
705 aa  1391    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  46.66 
 
 
725 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  47.18 
 
 
703 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  42.22 
 
 
715 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  42.22 
 
 
715 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  40.63 
 
 
700 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  40.06 
 
 
712 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  41.74 
 
 
710 aa  442  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  36.92 
 
 
700 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  36.39 
 
 
750 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  35.71 
 
 
711 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  36.72 
 
 
711 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  36.43 
 
 
699 aa  365  1e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  35.15 
 
 
669 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  37.68 
 
 
700 aa  362  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  38.33 
 
 
710 aa  359  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  35.12 
 
 
704 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  37.04 
 
 
698 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  34.94 
 
 
712 aa  349  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.66 
 
 
707 aa  348  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 
712 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  34.74 
 
 
708 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.36 
 
 
929 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.22 
 
 
706 aa  341  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 
704 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  31.15 
 
 
702 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  31.11 
 
 
703 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
889 aa  340  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.74 
 
 
702 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.91 
 
 
711 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.99 
 
 
706 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  33.61 
 
 
696 aa  337  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
711 aa  336  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.76 
 
 
698 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  32.01 
 
 
905 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.61 
 
 
892 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.95 
 
 
703 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.45 
 
 
696 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
918 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.12 
 
 
711 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.59 
 
 
699 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.97 
 
 
697 aa  327  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
893 aa  327  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.45 
 
 
892 aa  326  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  35.92 
 
 
728 aa  325  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.15 
 
 
698 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.29 
 
 
920 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  36.52 
 
 
699 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  33.57 
 
 
700 aa  320  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  31.96 
 
 
701 aa  317  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
893 aa  316  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.29 
 
 
897 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  33.57 
 
 
900 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.39 
 
 
699 aa  313  6.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.7 
 
 
718 aa  313  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.69 
 
 
895 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.27 
 
 
911 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.77 
 
 
704 aa  306  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  35.16 
 
 
708 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  32.21 
 
 
913 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.73 
 
 
912 aa  303  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  34.56 
 
 
718 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
695 aa  299  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  35.14 
 
 
695 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33.29 
 
 
709 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
698 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.28 
 
 
915 aa  297  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.66 
 
 
715 aa  296  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  34.26 
 
 
697 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.42 
 
 
697 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.13 
 
 
921 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.2 
 
 
692 aa  293  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.37 
 
 
714 aa  290  4e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  33.48 
 
 
718 aa  290  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.85 
 
 
715 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.56 
 
 
695 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
907 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  32.68 
 
 
697 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  29.37 
 
 
660 aa  283  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
907 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  35.79 
 
 
699 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  33.47 
 
 
705 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
907 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.53 
 
 
698 aa  278  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
699 aa  276  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  33.43 
 
 
899 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  30.5 
 
 
685 aa  275  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  31.97 
 
 
702 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.67 
 
 
727 aa  275  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  35.43 
 
 
714 aa  274  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  33.62 
 
 
741 aa  273  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  33.43 
 
 
729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  33.66 
 
 
897 aa  270  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.54 
 
 
904 aa  270  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
897 aa  267  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0296  CoA-binding domain protein  36.94 
 
 
707 aa  267  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000033493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 
708 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.87 
 
 
911 aa  265  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.8 
 
 
903 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
903 aa  261  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>