More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3702 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  100 
 
 
725 aa  1430    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  71.91 
 
 
703 aa  944    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  46.66 
 
 
705 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  40.05 
 
 
715 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  40.19 
 
 
715 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  39.78 
 
 
700 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  40.72 
 
 
712 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  37.73 
 
 
710 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  37.2 
 
 
699 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  35.15 
 
 
700 aa  360  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  36.6 
 
 
711 aa  347  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  36.19 
 
 
889 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.88 
 
 
704 aa  345  1e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.75 
 
 
669 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.79 
 
 
707 aa  343  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.21 
 
 
696 aa  337  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.59 
 
 
892 aa  333  7.000000000000001e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.79 
 
 
929 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.65 
 
 
697 aa  330  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.13 
 
 
698 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  34.54 
 
 
695 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.14 
 
 
711 aa  327  3e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
701 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
712 aa  328  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  35.03 
 
 
897 aa  326  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.79 
 
 
706 aa  325  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  31.1 
 
 
702 aa  325  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.91 
 
 
905 aa  324  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.82 
 
 
703 aa  323  8e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  34.85 
 
 
697 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 
704 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.64 
 
 
710 aa  321  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  34.67 
 
 
695 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.68 
 
 
702 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
893 aa  319  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  35.05 
 
 
893 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  35.93 
 
 
712 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  32.08 
 
 
750 aa  317  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.07 
 
 
699 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  33.74 
 
 
697 aa  313  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.93 
 
 
711 aa  312  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.48 
 
 
895 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  34.7 
 
 
700 aa  311  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  35.2 
 
 
698 aa  311  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.61 
 
 
708 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  34.29 
 
 
715 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  34.29 
 
 
729 aa  310  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.2 
 
 
911 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.92 
 
 
698 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.66 
 
 
918 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.56 
 
 
892 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  33.98 
 
 
920 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  32.05 
 
 
913 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  31.52 
 
 
711 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.74 
 
 
703 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  31.62 
 
 
706 aa  302  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.3 
 
 
718 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  33.01 
 
 
702 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.77 
 
 
921 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
699 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.97 
 
 
711 aa  297  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.16 
 
 
700 aa  297  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.26 
 
 
915 aa  296  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.81 
 
 
903 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.85 
 
 
912 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.57 
 
 
714 aa  294  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  36.61 
 
 
716 aa  293  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.84 
 
 
900 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  29.43 
 
 
660 aa  291  4e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.84 
 
 
741 aa  291  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.92 
 
 
728 aa  291  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.85 
 
 
697 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
715 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  36.77 
 
 
707 aa  290  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  34.84 
 
 
705 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  34.88 
 
 
699 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  30.84 
 
 
696 aa  287  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  32.59 
 
 
766 aa  287  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  35.71 
 
 
897 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.94 
 
 
698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  32.96 
 
 
692 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  34.54 
 
 
693 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.2 
 
 
903 aa  279  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.45 
 
 
660 aa  278  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35.51 
 
 
904 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.14 
 
 
699 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  32.83 
 
 
718 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.55 
 
 
904 aa  270  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  33.11 
 
 
897 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.54 
 
 
704 aa  270  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  29.75 
 
 
697 aa  269  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
907 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  30.48 
 
 
698 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.42 
 
 
893 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.06 
 
 
727 aa  266  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.34 
 
 
695 aa  263  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 
907 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  31.89 
 
 
718 aa  260  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.14 
 
 
883 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  33.24 
 
 
896 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>