More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3312 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  51.24 
 
 		 697 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  90.87 
 
 		 702 aa  1241    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  56.09 
 
 		 695 aa  742    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  100 
 
 		 697 aa  1400    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  55.94 
 
 		 695 aa  726    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  45.79 
 
 		 699 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  43.99 
 
 		 702 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  41.99 
 
 		 690 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  43.83 
 
 		 766 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.73 
 
 		 715 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.43 
 
 		 696 aa  340  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  32.91 
 
 		 699 aa  340  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.91 
 
 		 708 aa  335  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  31.91 
 
 		 700 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.38 
 
 		 911 aa  331  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 712 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  33.52 
 
 		 725 aa  330  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.36 
 
 		 697 aa  330  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  33.33 
 
 		 711 aa  327  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  33.57 
 
 		 703 aa  327  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  34.15 
 
 		 700 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 710 aa  324  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.86 
 
 		 715 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.84 
 
 		 702 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  32.48 
 
 		 750 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 702 aa  317  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 669 aa  316  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  32.66 
 
 		 692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  31.79 
 
 		 711 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 703 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.84 
 
 		 698 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.28 
 
 		 929 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 918 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  30.97 
 
 		 696 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.65 
 
 		 707 aa  300  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.34 
 
 		 892 aa  300  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.43 
 
 		 700 aa  300  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 698 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.17 
 
 		 897 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 704 aa  296  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.29 
 
 		 912 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.13 
 
 		 706 aa  292  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.91 
 
 		 915 aa  291  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 913 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 703 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 708 aa  286  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.47 
 
 		 895 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.89 
 
 		 893 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.9 
 
 		 921 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.93 
 
 		 892 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.2 
 
 		 920 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.48 
 
 		 698 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 705 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 701 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 711 aa  278  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.44 
 
 		 883 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.28 
 
 		 711 aa  278  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 911 aa  277  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  31.93 
 
 		 704 aa  277  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 706 aa  276  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.52 
 
 		 697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  31.93 
 
 		 712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 893 aa  275  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.05 
 
 		 905 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 712 aa  273  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.19 
 
 		 703 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.94 
 
 		 904 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 718 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  31.21 
 
 		 698 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  30.69 
 
 		 715 aa  269  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 903 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  30.56 
 
 		 741 aa  267  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  30.89 
 
 		 700 aa  267  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 		 899 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  30.74 
 
 		 729 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  33.05 
 
 		 714 aa  264  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.29 
 
 		 699 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.53 
 
 		 900 aa  261  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 		 889 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.37 
 
 		 903 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.36 
 
 		 695 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 893 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.79 
 
 		 897 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 893 aa  258  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  30.14 
 
 		 709 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 707 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  30.21 
 
 		 698 aa  253  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 711 aa  252  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  30.59 
 
 		 705 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 		 907 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  31.14 
 
 		 684 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  30 
 
 		 852 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  30.66 
 
 		 693 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 907 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 898 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  29.71 
 
 		 911 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 716 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  29.22 
 
 		 704 aa  244  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  29.89 
 
 		 728 aa  244  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>