More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3477 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
707 aa  1343    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  59.86 
 
 
729 aa  779    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  61.48 
 
 
705 aa  769    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  49.37 
 
 
741 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  43.44 
 
 
718 aa  502  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  39.19 
 
 
715 aa  353  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  34.49 
 
 
708 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  36.59 
 
 
718 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  37.5 
 
 
715 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  35.82 
 
 
700 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  36.06 
 
 
710 aa  332  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  35.34 
 
 
711 aa  323  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  38.26 
 
 
710 aa  323  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  33.57 
 
 
700 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  36.13 
 
 
700 aa  321  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  36.27 
 
 
711 aa  320  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  31.88 
 
 
706 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  37.27 
 
 
725 aa  312  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
712 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.71 
 
 
704 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.2 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  34.04 
 
 
715 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  31.31 
 
 
702 aa  303  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.94 
 
 
701 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.57 
 
 
699 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  31.17 
 
 
702 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  35.8 
 
 
695 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  29.87 
 
 
698 aa  300  5e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  33.8 
 
 
750 aa  300  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.76 
 
 
703 aa  299  9e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  30.04 
 
 
696 aa  299  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  37.43 
 
 
692 aa  297  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.97 
 
 
883 aa  297  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
893 aa  295  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  35.52 
 
 
695 aa  293  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.99 
 
 
698 aa  293  9e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  29.53 
 
 
711 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  36.05 
 
 
704 aa  293  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.57 
 
 
897 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.12 
 
 
697 aa  290  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  36.1 
 
 
712 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  35.63 
 
 
727 aa  289  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.11 
 
 
669 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.62 
 
 
929 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.43 
 
 
714 aa  287  5e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  35.81 
 
 
700 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  34.42 
 
 
709 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  36.5 
 
 
712 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  36.3 
 
 
698 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.75 
 
 
696 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.26 
 
 
911 aa  283  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.01 
 
 
706 aa  283  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.58 
 
 
921 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.52 
 
 
892 aa  282  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.24 
 
 
707 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.04 
 
 
920 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
698 aa  276  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.64 
 
 
697 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.85 
 
 
892 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.5 
 
 
912 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.54 
 
 
897 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  32.3 
 
 
708 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.29 
 
 
728 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.35 
 
 
703 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  32.76 
 
 
697 aa  271  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.55 
 
 
900 aa  270  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 
711 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  33.19 
 
 
890 aa  269  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.87 
 
 
915 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.65 
 
 
711 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  30.26 
 
 
684 aa  263  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  28.67 
 
 
905 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  37.05 
 
 
699 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  35.79 
 
 
716 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 
718 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.2 
 
 
704 aa  258  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  34.26 
 
 
703 aa  256  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  34.86 
 
 
696 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.53 
 
 
699 aa  254  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  33.38 
 
 
690 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.33 
 
 
697 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  35.42 
 
 
705 aa  253  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.66 
 
 
695 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
702 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  34.76 
 
 
696 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  33.76 
 
 
727 aa  247  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  34.98 
 
 
697 aa  247  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
899 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.05 
 
 
913 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  36.35 
 
 
926 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.93 
 
 
698 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.48 
 
 
895 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  32.1 
 
 
705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.38 
 
 
903 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
889 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.56 
 
 
702 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 
708 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  31.85 
 
 
699 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  31.56 
 
 
703 aa  239  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>