More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1008 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  63.82 
 
 		 699 aa  833    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  67.19 
 
 		 712 aa  915    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  66.24 
 
 		 704 aa  900    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 703 aa  1397    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  67.52 
 
 		 700 aa  909    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  72.6 
 
 		 698 aa  981    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  36.34 
 
 		 708 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  36.43 
 
 		 715 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 703 aa  360  6e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  35.09 
 
 		 750 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  34.28 
 
 		 699 aa  340  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.33 
 
 		 696 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  33.24 
 
 		 708 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 701 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  34.05 
 
 		 700 aa  324  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.48 
 
 		 715 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.49 
 
 		 697 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.86 
 
 		 696 aa  321  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.09 
 
 		 700 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.71 
 
 		 700 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 711 aa  316  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.9 
 
 		 699 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  34.75 
 
 		 711 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  34.65 
 
 		 715 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  35.19 
 
 		 710 aa  311  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  33.57 
 
 		 711 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  31.92 
 
 		 706 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.6 
 
 		 920 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 704 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 		 711 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.94 
 
 		 711 aa  306  9.000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 918 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.62 
 
 		 707 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.52 
 
 		 702 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 893 aa  304  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.31 
 
 		 712 aa  304  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  32.39 
 
 		 709 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  33.43 
 
 		 692 aa  302  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  33.8 
 
 		 913 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 702 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  35.16 
 
 		 903 aa  301  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.46 
 
 		 921 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 703 aa  297  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.01 
 
 		 669 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  31.39 
 
 		 698 aa  296  9e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  33.52 
 
 		 725 aa  296  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  33.2 
 
 		 708 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.13 
 
 		 712 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.11 
 
 		 699 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 710 aa  293  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.17 
 
 		 912 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.4 
 
 		 698 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  33.09 
 
 		 697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.66 
 
 		 911 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.38 
 
 		 883 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.53 
 
 		 929 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.03 
 
 		 897 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.48 
 
 		 892 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.84 
 
 		 893 aa  276  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 911 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.76 
 
 		 892 aa  272  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 695 aa  272  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.93 
 
 		 714 aa  272  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 698 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  33.82 
 
 		 904 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.4 
 
 		 697 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.45 
 
 		 915 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  31.44 
 
 		 699 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  33.66 
 
 		 703 aa  271  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 718 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.58 
 
 		 706 aa  269  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.29 
 
 		 695 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.04 
 
 		 895 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.77 
 
 		 695 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.61 
 
 		 728 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  31.21 
 
 		 709 aa  263  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.49 
 
 		 698 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.76 
 
 		 697 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  30.7 
 
 		 718 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.59 
 
 		 704 aa  258  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 		 896 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  31.38 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  31.4 
 
 		 702 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  33.86 
 
 		 716 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 893 aa  253  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.6 
 
 		 897 aa  253  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.63 
 
 		 900 aa  251  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.71 
 
 		 905 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.17 
 
 		 741 aa  250  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 		 898 aa  250  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  32.91 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 729 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 898 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  31.57 
 
 		 911 aa  248  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.15 
 
 		 715 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.64 
 
 		 904 aa  247  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  32.03 
 
 		 699 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 900 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  31.09 
 
 		 911 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>