More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3724 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  100 
 
 		 705 aa  1407    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  97.02 
 
 		 705 aa  1328    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  75.98 
 
 		 696 aa  1005    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  95.04 
 
 		 705 aa  1300    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  75.69 
 
 		 696 aa  996    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  43.23 
 
 		 684 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6428  CoA-binding domain protein  43 
 
 		 684 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.0804767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  40.11 
 
 		 680 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2794  CoA-binding  40.63 
 
 		 679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.319847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2176  CoA-binding domain-containing protein  39.48 
 
 		 687 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 710 aa  287  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.78 
 
 		 669 aa  282  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  30.54 
 
 		 708 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.95 
 
 		 704 aa  275  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 893 aa  273  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  29.01 
 
 		 711 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  32.73 
 
 		 718 aa  268  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  32.12 
 
 		 711 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 893 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  30.18 
 
 		 750 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  32.08 
 
 		 698 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.86 
 
 		 715 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.37 
 
 		 903 aa  256  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  30.52 
 
 		 700 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 718 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  30.92 
 
 		 741 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 700 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  30.08 
 
 		 712 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  28.94 
 
 		 729 aa  248  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.09 
 
 		 892 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  31.38 
 
 		 703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  30.04 
 
 		 699 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  30.32 
 
 		 725 aa  244  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 712 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  30.92 
 
 		 710 aa  237  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  28.15 
 
 		 708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.6 
 
 		 711 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  30 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 695 aa  233  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.65 
 
 		 695 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  26.8 
 
 		 895 aa  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  26.69 
 
 		 905 aa  231  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  30.68 
 
 		 715 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 913 aa  230  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.01 
 
 		 929 aa  230  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  32.28 
 
 		 699 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.19 
 
 		 912 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  30.1 
 
 		 697 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 699 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  30 
 
 		 897 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  28.39 
 
 		 700 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 711 aa  225  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 706 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  29.67 
 
 		 715 aa  224  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 701 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  31.34 
 
 		 705 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.45 
 
 		 697 aa  220  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 893 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  28.21 
 
 		 897 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  31.51 
 
 		 716 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  29.75 
 
 		 702 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  29.31 
 
 		 697 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  27.14 
 
 		 707 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  25.1 
 
 		 698 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 903 aa  216  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  28.59 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 708 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 712 aa  215  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.46 
 
 		 699 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  27.75 
 
 		 892 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  28.85 
 
 		 703 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 702 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  27.64 
 
 		 911 aa  212  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  25.88 
 
 		 696 aa  211  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  27.92 
 
 		 900 aa  210  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  30.42 
 
 		 690 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 703 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  28.82 
 
 		 920 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  28.93 
 
 		 703 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  27.99 
 
 		 698 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 703 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  26.86 
 
 		 702 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 		 889 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  26.53 
 
 		 904 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.35 
 
 		 698 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  27.62 
 
 		 700 aa  204  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  26.48 
 
 		 915 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 890 aa  203  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  27.63 
 
 		 704 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.39 
 
 		 714 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 		 883 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.5 
 
 		 699 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.44 
 
 		 696 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  27.89 
 
 		 921 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.01 
 
 		 706 aa  200  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  25.38 
 
 		 684 aa  200  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  27.95 
 
 		 709 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  27.59 
 
 		 718 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 		 893 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 704 aa  194  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>