More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3868 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  100 
 
 
711 aa  1451    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  51.07 
 
 
710 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  53.07 
 
 
708 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  37.02 
 
 
711 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.83 
 
 
750 aa  361  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.7 
 
 
698 aa  353  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.52 
 
 
700 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  36.36 
 
 
700 aa  351  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.85 
 
 
715 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
699 aa  341  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.19 
 
 
892 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  34.55 
 
 
700 aa  337  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.54 
 
 
697 aa  336  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.38 
 
 
707 aa  335  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  34.79 
 
 
698 aa  333  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
698 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.72 
 
 
696 aa  330  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.99 
 
 
715 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.95 
 
 
702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 
696 aa  327  6e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.66 
 
 
711 aa  326  9e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.99 
 
 
699 aa  326  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.66 
 
 
920 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.42 
 
 
703 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
705 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.67 
 
 
702 aa  325  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  30.1 
 
 
706 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  35.6 
 
 
712 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  35.19 
 
 
710 aa  322  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.17 
 
 
704 aa  319  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.86 
 
 
911 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.92 
 
 
929 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.69 
 
 
897 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.43 
 
 
699 aa  318  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.91 
 
 
921 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 
704 aa  317  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.62 
 
 
905 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.99 
 
 
895 aa  313  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.69 
 
 
893 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  33.62 
 
 
704 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  32.48 
 
 
698 aa  309  9e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.62 
 
 
712 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.54 
 
 
892 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  32.14 
 
 
703 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.32 
 
 
700 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.66 
 
 
706 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.72 
 
 
718 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.88 
 
 
712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.47 
 
 
900 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  33.33 
 
 
697 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.65 
 
 
912 aa  303  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.53 
 
 
711 aa  301  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.69 
 
 
728 aa  302  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
893 aa  300  7e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.41 
 
 
915 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33.57 
 
 
709 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
701 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
669 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.57 
 
 
703 aa  297  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  31.25 
 
 
725 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  33.19 
 
 
702 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.43 
 
 
699 aa  296  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
918 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  32.88 
 
 
729 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.43 
 
 
711 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  32.38 
 
 
695 aa  291  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
695 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  35.25 
 
 
707 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.13 
 
 
714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  34.23 
 
 
699 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.85 
 
 
903 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  30.51 
 
 
715 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.15 
 
 
893 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.75 
 
 
883 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  31.54 
 
 
718 aa  281  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  31.02 
 
 
708 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
698 aa  278  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  32.35 
 
 
709 aa  277  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  31.69 
 
 
697 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  31.81 
 
 
705 aa  273  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
889 aa  273  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.47 
 
 
913 aa  273  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  32.63 
 
 
716 aa  270  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  30.8 
 
 
696 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  29.01 
 
 
705 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  33.62 
 
 
904 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  30.69 
 
 
696 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  32.54 
 
 
727 aa  266  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.11 
 
 
741 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  30 
 
 
705 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.61 
 
 
727 aa  263  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  31.57 
 
 
899 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  30.1 
 
 
897 aa  260  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  29.44 
 
 
705 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  30.48 
 
 
692 aa  258  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
903 aa  257  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  28.59 
 
 
697 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  31.36 
 
 
911 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
907 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>