More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2759 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
729 aa  1430    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  62.67 
 
 
705 aa  827    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  59.01 
 
 
707 aa  731    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  43.95 
 
 
741 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  40.69 
 
 
718 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  35.46 
 
 
715 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.25 
 
 
669 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  34.81 
 
 
715 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  34.3 
 
 
718 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  32.93 
 
 
700 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  34.67 
 
 
710 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  30.51 
 
 
706 aa  308  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  34.16 
 
 
725 aa  303  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.51 
 
 
708 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  32.83 
 
 
710 aa  301  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  33.15 
 
 
711 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  34.24 
 
 
700 aa  295  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  30.83 
 
 
704 aa  293  7e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  32.14 
 
 
711 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.78 
 
 
711 aa  291  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  32.27 
 
 
715 aa  291  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  31.12 
 
 
699 aa  291  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.87 
 
 
698 aa  291  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 
712 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.25 
 
 
929 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.38 
 
 
911 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.02 
 
 
696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.07 
 
 
750 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.49 
 
 
697 aa  285  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  27.9 
 
 
711 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.37 
 
 
921 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
702 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.2 
 
 
703 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.11 
 
 
728 aa  277  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.55 
 
 
893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.45 
 
 
920 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.25 
 
 
702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
698 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.76 
 
 
712 aa  270  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  26.54 
 
 
701 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.22 
 
 
912 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.85 
 
 
698 aa  270  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  33.42 
 
 
712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.11 
 
 
707 aa  268  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  33.38 
 
 
700 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.9 
 
 
915 aa  268  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  30.27 
 
 
708 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.09 
 
 
706 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  32.46 
 
 
709 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  32.52 
 
 
698 aa  265  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  33.2 
 
 
704 aa  264  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
918 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.09 
 
 
714 aa  263  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  30.31 
 
 
700 aa  262  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.4 
 
 
699 aa  263  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.97 
 
 
699 aa  263  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
727 aa  262  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  31.35 
 
 
692 aa  260  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  32.66 
 
 
690 aa  259  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.88 
 
 
892 aa  259  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  31.75 
 
 
703 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  30.9 
 
 
883 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.67 
 
 
897 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  31.36 
 
 
711 aa  257  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.88 
 
 
905 aa  255  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.52 
 
 
892 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  34.06 
 
 
699 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  30.93 
 
 
897 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  32.47 
 
 
703 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.04 
 
 
900 aa  252  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  27.6 
 
 
696 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.37 
 
 
695 aa  251  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  29.07 
 
 
705 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
889 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  27.19 
 
 
698 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  28.43 
 
 
895 aa  246  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  31.76 
 
 
716 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.15 
 
 
697 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.09 
 
 
695 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  30.15 
 
 
697 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  29.34 
 
 
705 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  31.86 
 
 
904 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
704 aa  241  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.71 
 
 
702 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  29.48 
 
 
705 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
911 aa  239  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  28.81 
 
 
685 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  32.83 
 
 
926 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  33.43 
 
 
705 aa  239  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  30.62 
 
 
903 aa  238  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0454  CoA-binding domain protein  31.7 
 
 
690 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.98 
 
 
907 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  28.12 
 
 
913 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  29.89 
 
 
898 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  27.83 
 
 
697 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.35 
 
 
893 aa  230  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.22 
 
 
903 aa  230  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  32.38 
 
 
702 aa  230  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  30.61 
 
 
696 aa  230  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  30.71 
 
 
696 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>