More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5770 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  70.63 
 
 		 712 aa  954    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  66.24 
 
 		 703 aa  897    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 704 aa  1390    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  72.31 
 
 		 698 aa  966    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  72.53 
 
 		 699 aa  936    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  70.94 
 
 		 700 aa  954    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 715 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 703 aa  365  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 708 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  36.09 
 
 		 750 aa  359  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  37.34 
 
 		 700 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  37.09 
 
 		 715 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.28 
 
 		 699 aa  349  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  35.73 
 
 		 715 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  37.81 
 
 		 712 aa  344  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  36.15 
 
 		 711 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 702 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  36.34 
 
 		 710 aa  337  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.84 
 
 		 700 aa  337  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.43 
 
 		 696 aa  336  7.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 703 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  33.75 
 
 		 708 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 702 aa  331  3e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.53 
 
 		 711 aa  331  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 696 aa  330  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.45 
 
 		 706 aa  326  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 704 aa  324  3e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 893 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  36.01 
 
 		 903 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  33.62 
 
 		 711 aa  320  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  35.06 
 
 		 692 aa  319  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  35.33 
 
 		 710 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 669 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 705 aa  314  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 711 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  34.18 
 
 		 709 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  34.93 
 
 		 725 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.63 
 
 		 920 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.9 
 
 		 697 aa  308  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.86 
 
 		 711 aa  307  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.38 
 
 		 699 aa  307  6e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  34.28 
 
 		 913 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 706 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.48 
 
 		 698 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  33.1 
 
 		 700 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 701 aa  300  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  34.73 
 
 		 703 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  36.21 
 
 		 904 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.95 
 
 		 892 aa  298  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.37 
 
 		 929 aa  298  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.87 
 
 		 699 aa  298  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.99 
 
 		 911 aa  298  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 		 918 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.52 
 
 		 915 aa  297  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.11 
 
 		 714 aa  296  6e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 718 aa  294  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.58 
 
 		 697 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.54 
 
 		 707 aa  292  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.86 
 
 		 883 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  31.7 
 
 		 698 aa  290  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  32.61 
 
 		 697 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  32.07 
 
 		 708 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.68 
 
 		 912 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.92 
 
 		 921 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.79 
 
 		 695 aa  280  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.68 
 
 		 704 aa  279  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  32.95 
 
 		 705 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.96 
 
 		 892 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.94 
 
 		 695 aa  277  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  32.5 
 
 		 699 aa  277  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  34.19 
 
 		 714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 698 aa  275  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.67 
 
 		 897 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.14 
 
 		 715 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.96 
 
 		 698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 695 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  33.66 
 
 		 741 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  34.63 
 
 		 898 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.49 
 
 		 895 aa  270  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 716 aa  270  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.06 
 
 		 900 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.48 
 
 		 728 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 893 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.56 
 
 		 697 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  33.43 
 
 		 705 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 705 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  31.85 
 
 		 709 aa  261  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 893 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 926 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  33.2 
 
 		 729 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  31.3 
 
 		 718 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  30.74 
 
 		 900 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  35.74 
 
 		 707 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 		 893 aa  256  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.98 
 
 		 905 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.03 
 
 		 904 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 		 911 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  32.65 
 
 		 690 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  32.55 
 
 		 696 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>