More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1414 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  95.68 
 
 		 697 aa  1330    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 695 aa  1400    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.57 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  38.64 
 
 		 698 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  37.22 
 
 		 711 aa  452  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  38.18 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 698 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.34 
 
 		 697 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  35.24 
 
 		 701 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.28 
 
 		 699 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.13 
 
 		 929 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  35.99 
 
 		 712 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.7 
 
 		 711 aa  419  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  36.02 
 
 		 698 aa  421  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  33.99 
 
 		 905 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  35.77 
 
 		 696 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 704 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  34.23 
 
 		 912 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 706 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  34.27 
 
 		 920 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  33.9 
 
 		 921 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 		 893 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  34 
 
 		 911 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32.24 
 
 		 892 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.29 
 
 		 892 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  34.6 
 
 		 728 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.71 
 
 		 698 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 		 918 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  34.09 
 
 		 915 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.5 
 
 		 897 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  34.7 
 
 		 707 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  33.81 
 
 		 904 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.91 
 
 		 883 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.05 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35.38 
 
 		 904 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  33.9 
 
 		 704 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 669 aa  369  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 913 aa  365  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 898 aa  364  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 703 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 702 aa  362  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 		 889 aa  360  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  33.95 
 
 		 702 aa  360  4e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.14 
 
 		 893 aa  360  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.93 
 
 		 895 aa  356  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.86 
 
 		 900 aa  355  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 		 926 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.05 
 
 		 660 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  33.48 
 
 		 706 aa  353  7e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.48 
 
 		 926 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 660 aa  351  2e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.14 
 
 		 750 aa  347  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 911 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  34.14 
 
 		 709 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  31.25 
 
 		 976 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.29 
 
 		 699 aa  337  5.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.7 
 
 		 714 aa  337  5.999999999999999e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.24 
 
 		 903 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  31.95 
 
 		 886 aa  330  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  30.82 
 
 		 903 aa  330  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 727 aa  330  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  33.29 
 
 		 699 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 		 893 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  31.72 
 
 		 907 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 899 aa  326  8.000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 898 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  30.21 
 
 		 911 aa  326  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  35.65 
 
 		 887 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 		 907 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 887 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 893 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  30.8 
 
 		 682 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  30.36 
 
 		 950 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  30.88 
 
 		 902 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 		 899 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.06 
 
 		 897 aa  320  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  30.21 
 
 		 903 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 900 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  30.74 
 
 		 881 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 905 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 893 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  33.24 
 
 		 883 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 718 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 913 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  29.65 
 
 		 904 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  29.65 
 
 		 913 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  33.43 
 
 		 711 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 901 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 899 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 		 907 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  29.65 
 
 		 901 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  31.12 
 
 		 898 aa  310  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  30.59 
 
 		 911 aa  310  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.66 
 
 		 708 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  29.5 
 
 		 903 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  29.65 
 
 		 901 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 		 907 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  31.42 
 
 		 700 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  29.78 
 
 		 893 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 898 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>