More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0708 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
682 aa  1379    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.14 
 
 
669 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.48 
 
 
697 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.72 
 
 
696 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.36 
 
 
699 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
706 aa  360  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.19 
 
 
698 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  34.18 
 
 
696 aa  355  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.21 
 
 
700 aa  354  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.29 
 
 
707 aa  350  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  35.11 
 
 
911 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.09 
 
 
697 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.55 
 
 
701 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.48 
 
 
698 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.48 
 
 
711 aa  337  5e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.95 
 
 
883 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  33.38 
 
 
915 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  32.62 
 
 
921 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  30.24 
 
 
698 aa  327  3e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.65 
 
 
712 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  30.68 
 
 
698 aa  326  8.000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  32.58 
 
 
706 aa  325  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.94 
 
 
892 aa  323  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.81 
 
 
920 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.21 
 
 
699 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  32.1 
 
 
912 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.8 
 
 
695 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
711 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  31.38 
 
 
703 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.22 
 
 
889 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.44 
 
 
929 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.1 
 
 
704 aa  309  9e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  31 
 
 
702 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
918 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.68 
 
 
903 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.57 
 
 
702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.91 
 
 
897 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.24 
 
 
704 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.79 
 
 
714 aa  298  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  28.83 
 
 
905 aa  297  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.68 
 
 
892 aa  296  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.51 
 
 
893 aa  293  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.45 
 
 
900 aa  292  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
893 aa  290  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  30.23 
 
 
660 aa  288  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  31.7 
 
 
903 aa  286  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.29 
 
 
728 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 
693 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.29 
 
 
895 aa  279  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  32.84 
 
 
898 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
926 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  32.19 
 
 
699 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  30.5 
 
 
709 aa  273  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  30.62 
 
 
750 aa  272  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.12 
 
 
660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
904 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.49 
 
 
913 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  29.04 
 
 
700 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  29.83 
 
 
715 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
693 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  29.68 
 
 
715 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  30.42 
 
 
899 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  28.94 
 
 
697 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  30.17 
 
 
699 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  31.73 
 
 
727 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
911 aa  258  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.17 
 
 
904 aa  256  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  28.75 
 
 
926 aa  256  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  29.17 
 
 
703 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
710 aa  253  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
895 aa  252  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  29.03 
 
 
725 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  31.04 
 
 
907 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  29.25 
 
 
708 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
898 aa  249  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
901 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
908 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  30.39 
 
 
893 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
907 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  30.87 
 
 
697 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
897 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  28.41 
 
 
892 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
897 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  29.33 
 
 
886 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  32.13 
 
 
897 aa  244  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  29.28 
 
 
712 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  28.65 
 
 
685 aa  242  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  27.97 
 
 
950 aa  243  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  30.39 
 
 
897 aa  242  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
896 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  29.01 
 
 
902 aa  240  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
907 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  28.71 
 
 
697 aa  239  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  28.26 
 
 
903 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
896 aa  237  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  28.63 
 
 
898 aa  237  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  29.44 
 
 
901 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  28.02 
 
 
710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  27.87 
 
 
899 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>