More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0076 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  47.08 
 
 
711 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  48.22 
 
 
696 aa  647    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  69.91 
 
 
697 aa  999    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  70.11 
 
 
696 aa  979    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  52.28 
 
 
699 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  100 
 
 
698 aa  1389    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  87.39 
 
 
698 aa  1204    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  48.65 
 
 
706 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  49.43 
 
 
700 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  44.49 
 
 
701 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  46 
 
 
712 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  45.93 
 
 
698 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  47.02 
 
 
704 aa  570  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  45.34 
 
 
699 aa  568  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  43.08 
 
 
698 aa  568  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  44.4 
 
 
704 aa  568  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  42.49 
 
 
711 aa  551  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  43.3 
 
 
920 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  43.53 
 
 
929 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  43.29 
 
 
911 aa  538  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  42.19 
 
 
897 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  41.62 
 
 
921 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  45.91 
 
 
699 aa  528  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  41.08 
 
 
892 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  39.27 
 
 
702 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
918 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  39.27 
 
 
702 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  45.88 
 
 
709 aa  521  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  38.01 
 
 
703 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  41.8 
 
 
889 aa  515  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  40.37 
 
 
905 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  37.24 
 
 
706 aa  509  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  40.74 
 
 
915 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  39.89 
 
 
912 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  41.13 
 
 
892 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  39.3 
 
 
900 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 
669 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  39.91 
 
 
895 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  41.82 
 
 
893 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  40.37 
 
 
707 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  40.83 
 
 
893 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.85 
 
 
714 aa  479  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  39.6 
 
 
883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  39.32 
 
 
913 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  38.64 
 
 
697 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  39.4 
 
 
904 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  39.8 
 
 
903 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  38.64 
 
 
695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  39.69 
 
 
728 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  41.96 
 
 
904 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  38 
 
 
697 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  39.12 
 
 
903 aa  432  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 
893 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  39.34 
 
 
897 aa  425  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  39.8 
 
 
911 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  39.04 
 
 
893 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
896 aa  412  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  35.5 
 
 
896 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
892 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  38.52 
 
 
899 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
901 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  37.57 
 
 
918 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  35.26 
 
 
905 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  35.12 
 
 
913 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
898 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
896 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
908 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  35.12 
 
 
903 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  35.26 
 
 
901 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  35.4 
 
 
899 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  35.26 
 
 
901 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  38.44 
 
 
890 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  37.92 
 
 
907 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  35.26 
 
 
901 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  35.12 
 
 
913 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  34.98 
 
 
904 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  36.8 
 
 
750 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  38.88 
 
 
926 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  35.41 
 
 
911 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  36.44 
 
 
897 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  36.34 
 
 
926 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.89 
 
 
660 aa  390  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
900 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
898 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  33.76 
 
 
900 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  38.36 
 
 
897 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  34.38 
 
 
894 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  36.39 
 
 
902 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  36.51 
 
 
881 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  34.09 
 
 
911 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  34.65 
 
 
892 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  38.23 
 
 
902 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
907 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  38.21 
 
 
898 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  37.39 
 
 
907 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
897 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  35.68 
 
 
708 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.57 
 
 
699 aa  379  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
895 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
898 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>