More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2035 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  100 
 
 
727 aa  1411    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  41.22 
 
 
728 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  34.41 
 
 
707 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.74 
 
 
929 aa  353  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.57 
 
 
918 aa  333  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 
704 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.03 
 
 
698 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.43 
 
 
696 aa  327  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  33.62 
 
 
920 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.75 
 
 
892 aa  324  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.79 
 
 
911 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.28 
 
 
697 aa  317  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  34.08 
 
 
698 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.32 
 
 
706 aa  314  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.92 
 
 
905 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.02 
 
 
921 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.98 
 
 
669 aa  312  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  33.43 
 
 
708 aa  311  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.13 
 
 
712 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.94 
 
 
710 aa  307  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.78 
 
 
893 aa  303  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.95 
 
 
883 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.6 
 
 
912 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  33.9 
 
 
699 aa  300  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.07 
 
 
915 aa  300  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  31.69 
 
 
701 aa  300  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  34.07 
 
 
711 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.02 
 
 
697 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.34 
 
 
702 aa  299  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.01 
 
 
900 aa  296  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.49 
 
 
696 aa  296  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.78 
 
 
897 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.03 
 
 
699 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.47 
 
 
715 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
893 aa  293  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  28.96 
 
 
703 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.42 
 
 
711 aa  293  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.92 
 
 
702 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.56 
 
 
892 aa  291  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.28 
 
 
727 aa  289  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  32.54 
 
 
711 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  29.68 
 
 
698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.56 
 
 
695 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.52 
 
 
895 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.9 
 
 
706 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  32.4 
 
 
709 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.8 
 
 
913 aa  279  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
715 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  35.18 
 
 
710 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  31.83 
 
 
711 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.39 
 
 
714 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  33.29 
 
 
700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.05 
 
 
704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  32.38 
 
 
700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  28.53 
 
 
660 aa  272  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
889 aa  271  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.9 
 
 
904 aa  269  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35.06 
 
 
904 aa  267  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
898 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.72 
 
 
741 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  31.68 
 
 
697 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.22 
 
 
660 aa  262  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.87 
 
 
903 aa  262  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
697 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  31.98 
 
 
693 aa  258  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  29.14 
 
 
900 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  31.73 
 
 
682 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  30.12 
 
 
903 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  32.87 
 
 
712 aa  254  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  32.54 
 
 
718 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  33.57 
 
 
695 aa  251  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7443  CoA-binding domain protein  34.08 
 
 
707 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.96 
 
 
704 aa  249  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.7 
 
 
725 aa  249  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  29.74 
 
 
904 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  32.59 
 
 
703 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  33.84 
 
 
887 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 
913 aa  247  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
718 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
695 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
700 aa  246  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  31.44 
 
 
699 aa  246  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 
913 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  29.81 
 
 
901 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  29.67 
 
 
901 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  31.02 
 
 
692 aa  243  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  32.09 
 
 
698 aa  241  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.92 
 
 
897 aa  240  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  33.38 
 
 
712 aa  240  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
890 aa  240  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  32.49 
 
 
709 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
895 aa  239  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
903 aa  239  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  34.1 
 
 
705 aa  238  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
896 aa  236  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  30.07 
 
 
718 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
904 aa  234  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 
901 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  32.39 
 
 
693 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 
908 aa  234  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>