More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0842 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  52.45 
 
 		 711 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  100 
 
 		 700 aa  1412    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  36.78 
 
 		 710 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.81 
 
 		 699 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.67 
 
 		 700 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  35.62 
 
 		 750 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  37.64 
 
 		 703 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.27 
 
 		 706 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.72 
 
 		 696 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.99 
 
 		 718 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.44 
 
 		 697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  34.52 
 
 		 711 aa  356  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 705 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 715 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 669 aa  354  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 702 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  35.15 
 
 		 725 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.24 
 
 		 708 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.29 
 
 		 715 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 703 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 702 aa  349  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.7 
 
 		 710 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30 
 
 		 711 aa  346  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  36.32 
 
 		 741 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.86 
 
 		 696 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.05 
 
 		 698 aa  339  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 712 aa  339  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.84 
 
 		 704 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.68 
 
 		 905 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.63 
 
 		 706 aa  336  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.86 
 
 		 711 aa  335  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  34.28 
 
 		 695 aa  333  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 712 aa  333  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.81 
 
 		 699 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 704 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  34.33 
 
 		 712 aa  327  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.26 
 
 		 892 aa  324  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 695 aa  324  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.57 
 
 		 714 aa  323  4e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  34.09 
 
 		 703 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.94 
 
 		 895 aa  320  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  32.24 
 
 		 702 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32 
 
 		 700 aa  319  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  33.7 
 
 		 700 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.99 
 
 		 929 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 698 aa  317  4e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 698 aa  316  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.99 
 
 		 893 aa  316  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.91 
 
 		 697 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 		 698 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35.71 
 
 		 904 aa  312  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.18 
 
 		 728 aa  312  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 918 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.18 
 
 		 897 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  33.71 
 
 		 705 aa  306  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.29 
 
 		 715 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  35.16 
 
 		 714 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  32.02 
 
 		 718 aa  304  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.74 
 
 		 892 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.12 
 
 		 915 aa  303  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  32.08 
 
 		 697 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  30.35 
 
 		 707 aa  301  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  32.96 
 
 		 692 aa  299  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  35.13 
 
 		 707 aa  299  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 913 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.06 
 
 		 911 aa  298  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 701 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.3 
 
 		 912 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 898 aa  296  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 		 900 aa  294  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.79 
 
 		 921 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 		 889 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  30.29 
 
 		 709 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 		 718 aa  290  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 900 aa  290  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.36 
 
 		 698 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.18 
 
 		 900 aa  287  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  30.31 
 
 		 903 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 693 aa  283  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.94 
 
 		 883 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 711 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 727 aa  282  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  30.95 
 
 		 708 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 		 896 aa  282  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 913 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 905 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 		 896 aa  280  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 901 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 766 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  30.03 
 
 		 904 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 901 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 913 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.71 
 
 		 904 aa  278  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 899 aa  276  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.01 
 
 		 697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  30.73 
 
 		 901 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 893 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  30.4 
 
 		 911 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  31.35 
 
 		 699 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>