More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5094 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  100 
 
 
718 aa  1411    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  46.32 
 
 
741 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  40.14 
 
 
729 aa  482  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  40.26 
 
 
705 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  43.38 
 
 
707 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.55 
 
 
700 aa  336  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.82 
 
 
718 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.55 
 
 
696 aa  320  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.38 
 
 
710 aa  316  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.55 
 
 
698 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.99 
 
 
697 aa  314  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  33.8 
 
 
715 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.36 
 
 
711 aa  302  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  34.08 
 
 
711 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.55 
 
 
704 aa  301  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.75 
 
 
692 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.76 
 
 
715 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  35.29 
 
 
710 aa  299  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  31.23 
 
 
698 aa  296  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  32.16 
 
 
700 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
712 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  30.78 
 
 
708 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.56 
 
 
712 aa  293  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 
893 aa  290  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  31.67 
 
 
711 aa  290  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  28 
 
 
701 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  29.92 
 
 
669 aa  287  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  27.68 
 
 
711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.68 
 
 
699 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  30.18 
 
 
706 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.13 
 
 
921 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  29.99 
 
 
700 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.22 
 
 
929 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  33.61 
 
 
696 aa  280  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 
703 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  33.33 
 
 
696 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.75 
 
 
702 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  32.73 
 
 
705 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.34 
 
 
911 aa  268  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.47 
 
 
702 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  33.61 
 
 
716 aa  266  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  27.5 
 
 
696 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.97 
 
 
725 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  31.43 
 
 
699 aa  265  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  30.41 
 
 
711 aa  263  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  30.37 
 
 
715 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
698 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.05 
 
 
706 aa  259  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  29.32 
 
 
728 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  33.24 
 
 
904 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  28.99 
 
 
915 aa  258  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.16 
 
 
697 aa  257  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  32.83 
 
 
705 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  29.79 
 
 
920 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.44 
 
 
892 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  32.59 
 
 
705 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  33.76 
 
 
693 aa  255  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  29.4 
 
 
704 aa  253  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  33.29 
 
 
690 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
705 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
918 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.3 
 
 
695 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.53 
 
 
892 aa  251  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.13 
 
 
905 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  29.82 
 
 
897 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  28.67 
 
 
750 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
889 aa  248  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.57 
 
 
897 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  28.86 
 
 
660 aa  246  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  29.03 
 
 
883 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  25.27 
 
 
714 aa  244  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  32.4 
 
 
703 aa  244  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  26.96 
 
 
912 aa  243  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  31.09 
 
 
698 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
926 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  29.9 
 
 
900 aa  242  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  32.11 
 
 
712 aa  240  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
903 aa  241  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  29.48 
 
 
709 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  28.85 
 
 
708 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  30.76 
 
 
704 aa  238  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  30.34 
 
 
727 aa  237  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  30.98 
 
 
703 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  29.06 
 
 
707 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  27.12 
 
 
895 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  31.44 
 
 
700 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  30.32 
 
 
693 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  33 
 
 
727 aa  234  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.24 
 
 
893 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
890 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  33.81 
 
 
702 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.95 
 
 
660 aa  230  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.07 
 
 
695 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  27.49 
 
 
698 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
893 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
901 aa  225  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
908 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.69 
 
 
695 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  27.15 
 
 
913 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  30.93 
 
 
680 aa  223  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>