More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  75.98 
 
 
705 aa  1044    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  98.71 
 
 
696 aa  1343    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  100 
 
 
696 aa  1360    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  76.7 
 
 
705 aa  1022    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  76.85 
 
 
705 aa  1024    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  42.06 
 
 
684 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6428  CoA-binding domain protein  42.26 
 
 
684 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.0804767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  39.83 
 
 
680 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2794  CoA-binding  39.54 
 
 
679 aa  439  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.319847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2176  CoA-binding domain-containing protein  40.06 
 
 
687 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  33.61 
 
 
718 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.63 
 
 
669 aa  286  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  30.8 
 
 
711 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.4 
 
 
708 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
710 aa  279  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  33.15 
 
 
711 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  34.64 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.77 
 
 
741 aa  273  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.17 
 
 
750 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  31.92 
 
 
712 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.5 
 
 
704 aa  264  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  31.29 
 
 
699 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.26 
 
 
893 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  31.3 
 
 
700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 
703 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  31.75 
 
 
712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
893 aa  254  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  32.39 
 
 
710 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 
718 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  29.63 
 
 
708 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.98 
 
 
715 aa  250  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  30.2 
 
 
729 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  32.45 
 
 
715 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
700 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  29.8 
 
 
700 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  31.97 
 
 
692 aa  241  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  31.08 
 
 
702 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  29.93 
 
 
697 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.07 
 
 
892 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  26.83 
 
 
696 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  27.34 
 
 
895 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  31.85 
 
 
705 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.29 
 
 
697 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  34.15 
 
 
707 aa  229  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.62 
 
 
905 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.56 
 
 
903 aa  226  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  30.63 
 
 
715 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  27.4 
 
 
701 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.59 
 
 
711 aa  225  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  32.48 
 
 
716 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.55 
 
 
702 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  32.49 
 
 
699 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  28.88 
 
 
913 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.54 
 
 
696 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
695 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.55 
 
 
702 aa  219  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.22 
 
 
699 aa  219  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  28.75 
 
 
892 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  28.71 
 
 
700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  30.94 
 
 
695 aa  217  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  27.68 
 
 
706 aa  217  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.37 
 
 
929 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  28.95 
 
 
911 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  32.6 
 
 
926 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  28.33 
 
 
703 aa  216  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  28.34 
 
 
900 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  27.25 
 
 
711 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.37 
 
 
912 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  27.82 
 
 
897 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
890 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  29.84 
 
 
897 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.22 
 
 
883 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.65 
 
 
698 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  30.46 
 
 
697 aa  211  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  29 
 
 
698 aa  210  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  30.84 
 
 
699 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  27.27 
 
 
698 aa  207  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  31.59 
 
 
715 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  27.3 
 
 
712 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  28.79 
 
 
711 aa  207  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  27.23 
 
 
685 aa  207  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.36 
 
 
706 aa  207  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  25.92 
 
 
698 aa  206  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  30.49 
 
 
893 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  29.02 
 
 
704 aa  204  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  27.13 
 
 
889 aa  203  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  28.75 
 
 
703 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.13 
 
 
918 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  26.12 
 
 
684 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  28.11 
 
 
709 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  27.09 
 
 
915 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  29.73 
 
 
766 aa  197  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  32.21 
 
 
714 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.52 
 
 
660 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  27.69 
 
 
920 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  29.43 
 
 
892 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  29.26 
 
 
727 aa  193  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  26.04 
 
 
704 aa  193  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  29.02 
 
 
893 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  28.02 
 
 
703 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>