More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5367 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 715 aa  1409    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  45.57 
 
 		 708 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 703 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  39.15 
 
 		 704 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  40.06 
 
 		 700 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  38.52 
 
 		 698 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  37.89 
 
 		 712 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  36.71 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 699 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 704 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  34.41 
 
 		 715 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.1 
 
 		 696 aa  320  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  36.32 
 
 		 710 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.5 
 
 		 715 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  36.24 
 
 		 712 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.03 
 
 		 699 aa  312  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 711 aa  309  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  33.7 
 
 		 750 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.6 
 
 		 700 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.81 
 
 		 892 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.57 
 
 		 698 aa  300  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.72 
 
 		 697 aa  300  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.15 
 
 		 711 aa  298  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 893 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 712 aa  293  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.02 
 
 		 706 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  32.81 
 
 		 700 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 669 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 701 aa  283  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  33.76 
 
 		 703 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 702 aa  280  6e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.83 
 
 		 725 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  32.12 
 
 		 699 aa  279  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 711 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.28 
 
 		 913 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.87 
 
 		 703 aa  279  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 702 aa  279  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.96 
 
 		 895 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  28.57 
 
 		 905 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 889 aa  272  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 918 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.49 
 
 		 708 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.82 
 
 		 897 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 698 aa  270  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  31.5 
 
 		 692 aa  269  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  31.59 
 
 		 711 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 706 aa  267  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.41 
 
 		 921 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 698 aa  266  7e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 705 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.26 
 
 		 929 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 710 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 893 aa  264  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  29.21 
 
 		 911 aa  264  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  30.91 
 
 		 707 aa  263  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.55 
 
 		 697 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.98 
 
 		 892 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.5 
 
 		 699 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 718 aa  260  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  33.14 
 
 		 704 aa  258  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.73 
 
 		 915 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.73 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  31.76 
 
 		 741 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.89 
 
 		 904 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.99 
 
 		 903 aa  253  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  29.21 
 
 		 696 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  30.3 
 
 		 698 aa  251  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.15 
 
 		 715 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  28.91 
 
 		 920 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  29.56 
 
 		 711 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  33.05 
 
 		 714 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  28.93 
 
 		 900 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.63 
 
 		 695 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  30.58 
 
 		 897 aa  240  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  29.54 
 
 		 728 aa  239  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  34.31 
 
 		 716 aa  237  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  32.67 
 
 		 699 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 		 903 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 900 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  31.27 
 
 		 705 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  29.36 
 
 		 697 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  30.79 
 
 		 695 aa  231  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 926 aa  230  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  29.97 
 
 		 695 aa  229  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  28.59 
 
 		 911 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.74 
 
 		 702 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 899 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 896 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  27.72 
 
 		 912 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  30.45 
 
 		 709 aa  225  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  31.26 
 
 		 699 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  43.47 
 
 		 690 aa  223  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  28.51 
 
 		 907 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  27.69 
 
 		 892 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 		 899 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  30.17 
 
 		 697 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  28.85 
 
 		 911 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  28.51 
 
 		 896 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 904 aa  219  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27 
 
 		 660 aa  218  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>