More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2530 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  51.4 
 
 
886 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  51.51 
 
 
886 aa  886    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  43.24 
 
 
901 aa  690    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  86.72 
 
 
896 aa  1603    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  79.02 
 
 
903 aa  1427    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  50.11 
 
 
877 aa  848    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  51.17 
 
 
880 aa  859    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  43.84 
 
 
897 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  45.47 
 
 
898 aa  777    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.51 
 
 
886 aa  886    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
896 aa  1844    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.17 
 
 
886 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  42.13 
 
 
903 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.17 
 
 
886 aa  891    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  40.18 
 
 
900 aa  663    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  50 
 
 
877 aa  852    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  46.03 
 
 
911 aa  779    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  45.31 
 
 
913 aa  813    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  79.46 
 
 
901 aa  1437    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  41.58 
 
 
893 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  52.34 
 
 
882 aa  871    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  80.02 
 
 
899 aa  1425    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  51.62 
 
 
886 aa  886    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  42.89 
 
 
890 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  43.28 
 
 
903 aa  723    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.06 
 
 
886 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  51.67 
 
 
882 aa  874    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  68.04 
 
 
899 aa  1227    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 
887 aa  881    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  81.47 
 
 
900 aa  1526    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 
893 aa  694    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  51.17 
 
 
880 aa  859    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  52.34 
 
 
882 aa  874    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  51.07 
 
 
894 aa  890    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  50.62 
 
 
893 aa  895    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  38.84 
 
 
897 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  79.58 
 
 
901 aa  1437    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  79.46 
 
 
913 aa  1434    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  79.24 
 
 
913 aa  1429    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  77.01 
 
 
900 aa  1420    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.51 
 
 
886 aa  886    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  79.46 
 
 
901 aa  1436    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  79.24 
 
 
905 aa  1432    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  51.62 
 
 
887 aa  899    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  80.47 
 
 
898 aa  1480    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  51.4 
 
 
886 aa  884    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  51.51 
 
 
888 aa  880    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  79.24 
 
 
904 aa  1430    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.17 
 
 
886 aa  891    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  51.51 
 
 
886 aa  887    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  51.4 
 
 
886 aa  884    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.28 
 
 
886 aa  887    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  40.18 
 
 
896 aa  668    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  51.17 
 
 
880 aa  859    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  75.78 
 
 
911 aa  1378    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.17 
 
 
886 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  47.88 
 
 
904 aa  828    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  52.16 
 
 
897 aa  946    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  43.58 
 
 
898 aa  744    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  38.7 
 
 
889 aa  623  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
915 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.52 
 
 
892 aa  621  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  38.79 
 
 
895 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  38.25 
 
 
892 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  37.82 
 
 
905 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  39.78 
 
 
902 aa  601  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  37.1 
 
 
915 aa  601  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  37.33 
 
 
911 aa  601  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.57 
 
 
929 aa  600  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  38.42 
 
 
897 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  38.44 
 
 
912 aa  595  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  38.43 
 
 
921 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
893 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  37.85 
 
 
915 aa  591  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
899 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  37.73 
 
 
887 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 
918 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  37.82 
 
 
897 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
907 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  38.39 
 
 
907 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  37.89 
 
 
903 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
907 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  37.57 
 
 
920 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
906 aa  555  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  35.45 
 
 
893 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  34.77 
 
 
896 aa  509  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
895 aa  505  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  34.07 
 
 
918 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
897 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
908 aa  498  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
901 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  34.37 
 
 
892 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
904 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  32.93 
 
 
892 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  34.2 
 
 
882 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
900 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  34.24 
 
 
918 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  34.54 
 
 
907 aa  476  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
891 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
900 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>