More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5203 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  100 
 
 		 711 aa  1421    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  52.45 
 
 		 700 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  38.21 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  39.04 
 
 		 710 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  37.02 
 
 		 711 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  37.14 
 
 		 700 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  37.93 
 
 		 715 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.85 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  37.83 
 
 		 699 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  34.98 
 
 		 708 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.97 
 
 		 697 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  36.29 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  35.52 
 
 		 718 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 710 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.14 
 
 		 698 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.19 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 711 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  36.91 
 
 		 712 aa  357  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.54 
 
 		 892 aa  355  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  36.15 
 
 		 704 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 712 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.67 
 
 		 711 aa  351  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.57 
 
 		 699 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.01 
 
 		 698 aa  347  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  37.17 
 
 		 703 aa  347  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 702 aa  347  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.66 
 
 		 897 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  35.52 
 
 		 712 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 700 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 703 aa  344  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  35.23 
 
 		 695 aa  343  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 706 aa  341  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 704 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 702 aa  340  7e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 705 aa  338  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 695 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.7 
 
 		 905 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.69 
 
 		 728 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  34.75 
 
 		 703 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 709 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 669 aa  330  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 		 893 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  34.08 
 
 		 715 aa  328  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.91 
 
 		 707 aa  325  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  33.38 
 
 		 918 aa  323  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 701 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.87 
 
 		 700 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 698 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 706 aa  318  3e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  32.73 
 
 		 708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  33.93 
 
 		 697 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.17 
 
 		 895 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32.59 
 
 		 892 aa  311  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.08 
 
 		 714 aa  310  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 889 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  33.7 
 
 		 718 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  34.4 
 
 		 705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.78 
 
 		 741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  32.39 
 
 		 702 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  34.2 
 
 		 697 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 913 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 893 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.17 
 
 		 915 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.09 
 
 		 920 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  35.01 
 
 		 699 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.02 
 
 		 929 aa  300  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.62 
 
 		 921 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.88 
 
 		 903 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.82 
 
 		 697 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.26 
 
 		 883 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.38 
 
 		 711 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  33.52 
 
 		 695 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  35.93 
 
 		 714 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  34.11 
 
 		 699 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.67 
 
 		 911 aa  293  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 729 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35 
 
 		 904 aa  291  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  35.99 
 
 		 707 aa  290  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.55 
 
 		 912 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  33.19 
 
 		 727 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.43 
 
 		 704 aa  286  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.43 
 
 		 900 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  32.08 
 
 		 705 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  33.29 
 
 		 692 aa  282  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.44 
 
 		 699 aa  281  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  32.94 
 
 		 690 aa  280  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 718 aa  280  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 696 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  33.15 
 
 		 696 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.14 
 
 		 698 aa  278  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.22 
 
 		 904 aa  276  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 		 898 aa  273  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 727 aa  272  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 900 aa  273  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  33.38 
 
 		 702 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 693 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 896 aa  271  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  33.01 
 
 		 897 aa  271  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 896 aa  270  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>