More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3178 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
718 aa  1440    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.55 
 
 
696 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.93 
 
 
698 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  33.99 
 
 
700 aa  362  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  35.52 
 
 
711 aa  361  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.54 
 
 
697 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
698 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.47 
 
 
728 aa  347  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.56 
 
 
711 aa  345  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.59 
 
 
883 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  32.01 
 
 
704 aa  340  4e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  31.28 
 
 
698 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  33.2 
 
 
750 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.52 
 
 
669 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.07 
 
 
708 aa  333  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.55 
 
 
892 aa  327  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.29 
 
 
699 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.45 
 
 
711 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 
701 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  33.2 
 
 
703 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  32.58 
 
 
699 aa  323  7e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  33.81 
 
 
700 aa  323  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  32.74 
 
 
702 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 
893 aa  321  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  32.57 
 
 
715 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  32.39 
 
 
715 aa  320  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  32.68 
 
 
718 aa  319  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.46 
 
 
700 aa  319  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.1 
 
 
741 aa  319  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.4 
 
 
696 aa  318  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  32.33 
 
 
702 aa  317  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  33.75 
 
 
729 aa  316  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.03 
 
 
697 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  31.72 
 
 
711 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  34.72 
 
 
710 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  32.72 
 
 
710 aa  310  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.01 
 
 
715 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  30.35 
 
 
706 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.51 
 
 
712 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
712 aa  308  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.97 
 
 
911 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.38 
 
 
707 aa  306  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.66 
 
 
921 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  31.34 
 
 
698 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.13 
 
 
905 aa  304  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
889 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  33.85 
 
 
705 aa  304  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.99 
 
 
892 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.59 
 
 
704 aa  301  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.35 
 
 
725 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  33.66 
 
 
703 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  35.99 
 
 
707 aa  299  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.17 
 
 
695 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.22 
 
 
920 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.69 
 
 
704 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.3 
 
 
699 aa  296  8e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.69 
 
 
897 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  32.01 
 
 
684 aa  293  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.81 
 
 
895 aa  293  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 
900 aa  293  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  33 
 
 
712 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  32.5 
 
 
698 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  30.76 
 
 
706 aa  291  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  29.22 
 
 
912 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
918 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.82 
 
 
911 aa  287  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  30.21 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.25 
 
 
929 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  32.37 
 
 
716 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  32.42 
 
 
697 aa  280  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.17 
 
 
703 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  32.31 
 
 
699 aa  278  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  31.33 
 
 
709 aa  279  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
893 aa  278  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  30.81 
 
 
913 aa  277  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  31.55 
 
 
711 aa  277  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
907 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 
893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.71 
 
 
714 aa  275  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
903 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  33.7 
 
 
705 aa  274  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
907 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
907 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.86 
 
 
903 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.7 
 
 
915 aa  272  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.53 
 
 
695 aa  271  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
896 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  32.08 
 
 
897 aa  266  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 
695 aa  266  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  29.75 
 
 
660 aa  266  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  32.26 
 
 
690 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  31.86 
 
 
692 aa  263  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2794  CoA-binding  31.26 
 
 
679 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.319847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  30.82 
 
 
898 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 
718 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  31.77 
 
 
703 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  31.77 
 
 
703 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  31.28 
 
 
700 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
899 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  31.64 
 
 
918 aa  256  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>