More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1097 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  83.53 
 
 
690 aa  1072    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  55.91 
 
 
766 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
702 aa  1371    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  46.2 
 
 
695 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  46.69 
 
 
697 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  45.91 
 
 
695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  43.59 
 
 
702 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  43.97 
 
 
697 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  45.12 
 
 
699 aa  485  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  33.57 
 
 
700 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  35.19 
 
 
712 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  31.65 
 
 
699 aa  296  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  33.94 
 
 
715 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  33.48 
 
 
692 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  33.38 
 
 
711 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.94 
 
 
750 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  31.88 
 
 
700 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  32.58 
 
 
710 aa  276  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
918 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.39 
 
 
704 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.78 
 
 
725 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.47 
 
 
697 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 
702 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.86 
 
 
718 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  29.5 
 
 
708 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  30.17 
 
 
711 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  27.8 
 
 
702 aa  265  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 
703 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  32.87 
 
 
703 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.99 
 
 
911 aa  263  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  32.35 
 
 
700 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  32.39 
 
 
698 aa  263  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.55 
 
 
706 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.29 
 
 
711 aa  260  7e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  35.93 
 
 
727 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.15 
 
 
929 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.48 
 
 
695 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.55 
 
 
696 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.79 
 
 
711 aa  251  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  33 
 
 
718 aa  251  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.11 
 
 
698 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  26.75 
 
 
698 aa  251  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  31.62 
 
 
712 aa  250  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  27.98 
 
 
912 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  32.22 
 
 
729 aa  248  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
706 aa  248  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  31.72 
 
 
741 aa  247  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  29.73 
 
 
707 aa  246  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  28.08 
 
 
669 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33 
 
 
711 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.33 
 
 
921 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  28.63 
 
 
704 aa  243  9e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  30.85 
 
 
708 aa  243  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.35 
 
 
697 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.35 
 
 
715 aa  240  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  40.5 
 
 
715 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  34.87 
 
 
707 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  29.81 
 
 
703 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  41.07 
 
 
710 aa  237  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  29.41 
 
 
698 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  28.43 
 
 
712 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  28.43 
 
 
895 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.32 
 
 
897 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  32.61 
 
 
699 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  29.56 
 
 
920 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.23 
 
 
892 aa  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  30.96 
 
 
727 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  32 
 
 
705 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.91 
 
 
892 aa  230  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  27.46 
 
 
696 aa  226  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  31.23 
 
 
911 aa  225  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  27.87 
 
 
915 aa  224  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  26.36 
 
 
701 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  29.3 
 
 
883 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.34 
 
 
728 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  30.44 
 
 
709 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
899 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  30.36 
 
 
705 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  38.06 
 
 
516 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  31.54 
 
 
705 aa  216  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  42.41 
 
 
715 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  38.84 
 
 
703 aa  215  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
926 aa  213  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  25 
 
 
714 aa  213  7e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 
893 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0454  CoA-binding domain protein  32.32 
 
 
690 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  29.17 
 
 
718 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.83 
 
 
699 aa  211  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
689 aa  210  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  30.26 
 
 
705 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  30.56 
 
 
693 aa  209  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.08 
 
 
903 aa  208  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  28.65 
 
 
893 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  30.5 
 
 
705 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  32.99 
 
 
693 aa  207  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  34.72 
 
 
700 aa  207  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  30.79 
 
 
696 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  28.99 
 
 
913 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  31.22 
 
 
696 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  31.56 
 
 
907 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>