More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6147 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  74.31 
 
 		 712 aa  996    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  72.6 
 
 		 703 aa  993    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  79.08 
 
 		 700 aa  1064    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 698 aa  1371    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  69.1 
 
 		 699 aa  907    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  72.31 
 
 		 704 aa  979    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 708 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  38.36 
 
 		 715 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  36.98 
 
 		 750 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  36.01 
 
 		 703 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.67 
 
 		 699 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  38.05 
 
 		 700 aa  359  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  36.29 
 
 		 711 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  37.95 
 
 		 710 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  34.65 
 
 		 711 aa  353  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  37.34 
 
 		 715 aa  353  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.57 
 
 		 696 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  34.31 
 
 		 708 aa  347  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  37.01 
 
 		 715 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 711 aa  341  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.26 
 
 		 696 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.17 
 
 		 699 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.14 
 
 		 711 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 669 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.73 
 
 		 697 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 893 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  36.85 
 
 		 712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 702 aa  327  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  33.24 
 
 		 701 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 702 aa  326  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.15 
 
 		 698 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.72 
 
 		 692 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  34.8 
 
 		 700 aa  325  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 711 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  34.64 
 
 		 913 aa  325  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 703 aa  324  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.14 
 
 		 707 aa  324  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 704 aa  324  4e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  36.89 
 
 		 705 aa  322  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 710 aa  321  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 712 aa  320  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  34.76 
 
 		 709 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  33.19 
 
 		 700 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  32.44 
 
 		 708 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.3 
 
 		 698 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 706 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.1 
 
 		 728 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  33.29 
 
 		 918 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.66 
 
 		 892 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  35.65 
 
 		 725 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 706 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.73 
 
 		 920 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.52 
 
 		 699 aa  302  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32.11 
 
 		 892 aa  300  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  33.24 
 
 		 697 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  35.43 
 
 		 903 aa  298  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.38 
 
 		 883 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  35.52 
 
 		 703 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.8 
 
 		 897 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 698 aa  295  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.4 
 
 		 921 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.82 
 
 		 893 aa  294  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.7 
 
 		 714 aa  293  7e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 718 aa  292  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  33 
 
 		 695 aa  291  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  33.76 
 
 		 714 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  33.14 
 
 		 695 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  32.55 
 
 		 915 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35.2 
 
 		 904 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.74 
 
 		 912 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.72 
 
 		 911 aa  286  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  33.19 
 
 		 697 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.28 
 
 		 929 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 695 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 911 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.9 
 
 		 698 aa  282  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 		 895 aa  280  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.32 
 
 		 704 aa  277  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.97 
 
 		 905 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  33.61 
 
 		 741 aa  273  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  31.99 
 
 		 705 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 893 aa  271  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  31.24 
 
 		 709 aa  269  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  31.28 
 
 		 718 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 		 926 aa  267  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  30.96 
 
 		 699 aa  266  8e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.59 
 
 		 889 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  33.71 
 
 		 699 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  32.37 
 
 		 705 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  34.64 
 
 		 696 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 729 aa  263  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 705 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  35.51 
 
 		 897 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  34.64 
 
 		 696 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.12 
 
 		 900 aa  260  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.29 
 
 		 903 aa  259  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 898 aa  257  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  31.39 
 
 		 680 aa  257  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  30.78 
 
 		 697 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 716 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>