More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3883 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  100 
 
 
697 aa  1383    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  61.69 
 
 
695 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  51.37 
 
 
702 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  51.37 
 
 
697 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  61.69 
 
 
695 aa  814    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  49.19 
 
 
699 aa  555  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  46.69 
 
 
702 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  45.91 
 
 
690 aa  515  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  44.93 
 
 
766 aa  364  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  36.93 
 
 
715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.98 
 
 
700 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.03 
 
 
699 aa  343  8e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  36.31 
 
 
715 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  34.78 
 
 
725 aa  330  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  36.19 
 
 
703 aa  329  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  35.48 
 
 
712 aa  321  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  34.86 
 
 
710 aa  316  9e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  33.24 
 
 
697 aa  316  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.24 
 
 
911 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.49 
 
 
929 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.52 
 
 
897 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.69 
 
 
912 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.54 
 
 
697 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  32.33 
 
 
700 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  34.51 
 
 
711 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
918 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  33.88 
 
 
913 aa  308  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  32.12 
 
 
708 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 
710 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.53 
 
 
696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.63 
 
 
915 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  32.47 
 
 
750 aa  300  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.23 
 
 
692 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.7 
 
 
695 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.34 
 
 
706 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.78 
 
 
698 aa  296  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.16 
 
 
892 aa  293  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.95 
 
 
711 aa  293  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  34.39 
 
 
712 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.75 
 
 
704 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.75 
 
 
903 aa  291  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.36 
 
 
698 aa  290  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.63 
 
 
718 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.09 
 
 
883 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.35 
 
 
703 aa  290  7e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.18 
 
 
708 aa  290  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  33.85 
 
 
698 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  32.91 
 
 
904 aa  289  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.01 
 
 
892 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.75 
 
 
702 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  31.93 
 
 
711 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.99 
 
 
920 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.57 
 
 
703 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
702 aa  286  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33.38 
 
 
709 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.47 
 
 
905 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.45 
 
 
893 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  29.99 
 
 
707 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.91 
 
 
741 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  30.14 
 
 
698 aa  280  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.2 
 
 
921 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.13 
 
 
900 aa  280  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.43 
 
 
706 aa  280  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  32.11 
 
 
715 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.74 
 
 
895 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 
911 aa  275  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.2 
 
 
700 aa  273  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.09 
 
 
897 aa  273  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
703 aa  273  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  32.52 
 
 
711 aa  273  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.75 
 
 
699 aa  273  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.25 
 
 
711 aa  270  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
889 aa  269  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 
696 aa  270  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  29.99 
 
 
712 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  33.91 
 
 
904 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  34.52 
 
 
705 aa  267  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  33.85 
 
 
714 aa  266  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
700 aa  265  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  35.31 
 
 
883 aa  265  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
893 aa  264  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  34.14 
 
 
898 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  33.15 
 
 
852 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.66 
 
 
728 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  33.47 
 
 
899 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  32.15 
 
 
727 aa  260  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 
890 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  27.15 
 
 
701 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
896 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  29.74 
 
 
896 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  28.96 
 
 
704 aa  258  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
926 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 
727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  30.86 
 
 
718 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  33.48 
 
 
716 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  30.22 
 
 
911 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.13 
 
 
699 aa  252  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  32.17 
 
 
693 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  29.09 
 
 
905 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>