More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1966 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  46.64 
 
 
696 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  63.6 
 
 
711 aa  933    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
712 aa  1444    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  51.21 
 
 
706 aa  704    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  45.57 
 
 
697 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
698 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  46 
 
 
698 aa  615  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  44.1 
 
 
929 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  44.35 
 
 
696 aa  571  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  42.6 
 
 
911 aa  558  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  43.61 
 
 
699 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  41.4 
 
 
920 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  42.49 
 
 
700 aa  544  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  42.07 
 
 
915 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  40.71 
 
 
699 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  42.13 
 
 
918 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  40.95 
 
 
921 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  41.02 
 
 
912 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  40 
 
 
698 aa  524  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
704 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  38.9 
 
 
698 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
889 aa  512  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  37.06 
 
 
701 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  40.2 
 
 
702 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  38.39 
 
 
905 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  37.99 
 
 
892 aa  505  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  40.48 
 
 
702 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  40.03 
 
 
703 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  39.39 
 
 
704 aa  498  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  39.14 
 
 
706 aa  496  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  37.86 
 
 
893 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  38.58 
 
 
897 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  37.76 
 
 
892 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  40.31 
 
 
711 aa  483  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  38.71 
 
 
714 aa  478  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  41.28 
 
 
699 aa  477  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  38.85 
 
 
707 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  39.09 
 
 
709 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  36.5 
 
 
900 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
669 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  35.24 
 
 
895 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  36.36 
 
 
913 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  35.68 
 
 
903 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  36.03 
 
 
697 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  35.55 
 
 
883 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  34.92 
 
 
904 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
893 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
893 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  35.99 
 
 
695 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  33.43 
 
 
697 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
903 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  36.24 
 
 
904 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  33.1 
 
 
893 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
907 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  34.65 
 
 
911 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
899 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  34.41 
 
 
728 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
897 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  36.94 
 
 
911 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  34.44 
 
 
911 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.38 
 
 
897 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
890 aa  389  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  33.2 
 
 
898 aa  389  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  35.23 
 
 
897 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  33.2 
 
 
896 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.6 
 
 
660 aa  378  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  32.92 
 
 
903 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
896 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 
907 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  32.78 
 
 
901 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
900 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  32.78 
 
 
908 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
898 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  32.64 
 
 
899 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 
907 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.96 
 
 
926 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  33.43 
 
 
898 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
896 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  32.86 
 
 
894 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
913 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 
913 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
904 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
900 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
897 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  31.94 
 
 
905 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
901 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  33.24 
 
 
918 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  33.57 
 
 
886 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
901 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  33.57 
 
 
886 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
893 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
895 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  32.49 
 
 
750 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  32.23 
 
 
901 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.43 
 
 
886 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.43 
 
 
886 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  33.29 
 
 
886 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
926 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  34.92 
 
 
710 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
899 aa  361  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>