More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1004 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
883 aa  1698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  43.5 
 
 
911 aa  561  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  44.01 
 
 
898 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  42.29 
 
 
926 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  40.09 
 
 
883 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  38.66 
 
 
926 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  38.45 
 
 
886 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  40.37 
 
 
904 aa  459  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  40.87 
 
 
887 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  37.02 
 
 
899 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  36.95 
 
 
893 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  37.78 
 
 
852 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  36.87 
 
 
881 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  35.09 
 
 
903 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  34.09 
 
 
976 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  37.42 
 
 
902 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  35.29 
 
 
894 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  36.47 
 
 
887 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  37.5 
 
 
902 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
868 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
901 aa  399  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.65 
 
 
696 aa  396  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  34.31 
 
 
907 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  33.54 
 
 
950 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.18 
 
 
909 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  41.4 
 
 
821 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.85 
 
 
699 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.76 
 
 
697 aa  376  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 
872 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  36.92 
 
 
909 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
909 aa  365  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.22 
 
 
908 aa  366  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.89 
 
 
711 aa  363  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  36.16 
 
 
698 aa  360  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.11 
 
 
929 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  36.28 
 
 
920 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.01 
 
 
907 aa  357  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  34.99 
 
 
911 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.64 
 
 
706 aa  354  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.45 
 
 
701 aa  354  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.3 
 
 
831 aa  352  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.81 
 
 
712 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  34.66 
 
 
698 aa  346  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  35.52 
 
 
907 aa  344  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  35.41 
 
 
704 aa  342  1e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.64 
 
 
700 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  33.29 
 
 
697 aa  340  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.19 
 
 
707 aa  330  7e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.45 
 
 
921 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
775 aa  327  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  34.4 
 
 
893 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
918 aa  326  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 
696 aa  324  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.18 
 
 
706 aa  324  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
698 aa  323  8e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.94 
 
 
915 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.19 
 
 
699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.24 
 
 
695 aa  320  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.27 
 
 
702 aa  319  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
702 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.69 
 
 
711 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  32.63 
 
 
698 aa  312  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.9 
 
 
703 aa  312  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.83 
 
 
912 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.65 
 
 
905 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  40.35 
 
 
899 aa  308  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  37.54 
 
 
771 aa  304  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.15 
 
 
920 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.49 
 
 
895 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.18 
 
 
704 aa  294  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.81 
 
 
900 aa  294  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.91 
 
 
913 aa  291  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  33.15 
 
 
977 aa  291  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
693 aa  289  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.74 
 
 
669 aa  289  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.5 
 
 
892 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  36.02 
 
 
697 aa  288  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.42 
 
 
897 aa  288  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
899 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.05 
 
 
750 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
727 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.78 
 
 
728 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  35.01 
 
 
707 aa  284  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.25 
 
 
903 aa  284  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.9 
 
 
714 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  34.28 
 
 
693 aa  283  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
889 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.78 
 
 
892 aa  280  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
897 aa  278  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  30.19 
 
 
697 aa  275  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  37.12 
 
 
867 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
900 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  32.36 
 
 
907 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.94 
 
 
893 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
896 aa  270  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
893 aa  269  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  35.48 
 
 
637 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.18 
 
 
904 aa  267  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
893 aa  267  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
718 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>