More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1998 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  69.77 
 
 
707 aa  879    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
977 aa  1868    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  43.95 
 
 
887 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  44.29 
 
 
902 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  43.39 
 
 
881 aa  582  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  41.93 
 
 
926 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  39.65 
 
 
976 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  41.86 
 
 
902 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  40.02 
 
 
907 aa  552  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  40.31 
 
 
903 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  39.59 
 
 
950 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  39.96 
 
 
893 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  38.67 
 
 
899 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  42.23 
 
 
821 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  41.44 
 
 
899 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  40.42 
 
 
920 aa  489  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
872 aa  485  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
901 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  38.94 
 
 
911 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  35.72 
 
 
894 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
868 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  39.28 
 
 
883 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  37.47 
 
 
909 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  38.94 
 
 
904 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  38.99 
 
 
909 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  36.11 
 
 
898 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  35.14 
 
 
886 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
926 aa  406  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  34.88 
 
 
831 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.28 
 
 
907 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
907 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
909 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 
712 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.43 
 
 
711 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  37.87 
 
 
887 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.33 
 
 
934 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
926 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.49 
 
 
698 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  35.39 
 
 
852 aa  354  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.72 
 
 
697 aa  349  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.24 
 
 
706 aa  347  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.4 
 
 
908 aa  347  8e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.41 
 
 
696 aa  346  8.999999999999999e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.66 
 
 
699 aa  346  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.21 
 
 
929 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.67 
 
 
698 aa  342  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 
775 aa  338  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  34.63 
 
 
911 aa  337  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.34 
 
 
915 aa  336  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
883 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
867 aa  334  5e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.81 
 
 
700 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.99 
 
 
696 aa  330  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.24 
 
 
920 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
918 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.15 
 
 
921 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
771 aa  312  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.9 
 
 
912 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.29 
 
 
707 aa  310  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  33 
 
 
637 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.6 
 
 
697 aa  305  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
701 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.23 
 
 
698 aa  304  7.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.78 
 
 
704 aa  295  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.29 
 
 
669 aa  294  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.74 
 
 
695 aa  290  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.43 
 
 
699 aa  290  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 
893 aa  288  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.29 
 
 
702 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.3 
 
 
892 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.73 
 
 
706 aa  283  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  28.51 
 
 
703 aa  283  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.01 
 
 
702 aa  281  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.99 
 
 
897 aa  278  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.35 
 
 
892 aa  275  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.15 
 
 
903 aa  270  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.51 
 
 
900 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.52 
 
 
905 aa  268  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.73 
 
 
698 aa  266  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
889 aa  266  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.86 
 
 
904 aa  265  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.36 
 
 
727 aa  264  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.27 
 
 
704 aa  264  8e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
893 aa  263  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  25.64 
 
 
714 aa  263  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  27.79 
 
 
895 aa  263  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.96 
 
 
711 aa  261  5.0000000000000005e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  34.04 
 
 
693 aa  253  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.58 
 
 
913 aa  250  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  29.96 
 
 
697 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  30.82 
 
 
708 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  29.29 
 
 
682 aa  244  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.35 
 
 
728 aa  243  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  28.77 
 
 
911 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  31.62 
 
 
715 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  31.7 
 
 
712 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.79 
 
 
893 aa  241  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
898 aa  239  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
693 aa  237  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 
898 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>