More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1462 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  46.57 
 
 
907 aa  662    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  49.89 
 
 
881 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  51.61 
 
 
902 aa  722    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  47.31 
 
 
887 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
868 aa  1674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 
893 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  52.97 
 
 
926 aa  777    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  45.41 
 
 
950 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  51.79 
 
 
902 aa  742    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  90.59 
 
 
909 aa  1370    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  46.11 
 
 
976 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  46.92 
 
 
899 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  44.97 
 
 
903 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  43.37 
 
 
901 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  43.73 
 
 
894 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  44.58 
 
 
909 aa  608  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  45.5 
 
 
899 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  45.8 
 
 
872 aa  578  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  52.19 
 
 
821 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  45.36 
 
 
920 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  42.34 
 
 
934 aa  545  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.78 
 
 
907 aa  529  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  41.43 
 
 
911 aa  525  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
909 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  38.72 
 
 
883 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  42.15 
 
 
907 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  39.34 
 
 
831 aa  501  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 
926 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  39.73 
 
 
908 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  39.56 
 
 
898 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  39.77 
 
 
904 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  38.45 
 
 
887 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  37.36 
 
 
886 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  38.11 
 
 
926 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  39.32 
 
 
977 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  37.12 
 
 
883 aa  422  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  41.45 
 
 
707 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  40.36 
 
 
867 aa  383  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  34.92 
 
 
852 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  38.21 
 
 
775 aa  366  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.76 
 
 
698 aa  354  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  36.33 
 
 
698 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.47 
 
 
696 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
771 aa  338  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  34.2 
 
 
698 aa  332  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  35.06 
 
 
911 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.57 
 
 
697 aa  330  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.41 
 
 
699 aa  323  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 
696 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
918 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.72 
 
 
706 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.4 
 
 
700 aa  313  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.68 
 
 
699 aa  306  8.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.52 
 
 
929 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.05 
 
 
707 aa  306  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.06 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.72 
 
 
920 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.47 
 
 
921 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.65 
 
 
912 aa  298  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.33 
 
 
698 aa  297  5e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.54 
 
 
701 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
711 aa  289  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  30.62 
 
 
704 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  37.27 
 
 
637 aa  287  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  28.77 
 
 
712 aa  287  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.6 
 
 
915 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.07 
 
 
900 aa  284  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.51 
 
 
697 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.77 
 
 
897 aa  282  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.35 
 
 
711 aa  276  9e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3654  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
795 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.035064  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.27 
 
 
704 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  29.38 
 
 
697 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 
893 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.23 
 
 
695 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.96 
 
 
905 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.32 
 
 
728 aa  262  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.69 
 
 
892 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
889 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  30.76 
 
 
682 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  28.77 
 
 
892 aa  248  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.43 
 
 
699 aa  246  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.95 
 
 
904 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
893 aa  243  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  31.87 
 
 
709 aa  243  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  27.37 
 
 
895 aa  241  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
903 aa  238  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.07 
 
 
903 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  31.28 
 
 
715 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  31.64 
 
 
729 aa  234  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  31.24 
 
 
715 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  31.88 
 
 
725 aa  233  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  30.67 
 
 
718 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  25.62 
 
 
714 aa  232  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
898 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.95 
 
 
897 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  26.43 
 
 
905 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  26.51 
 
 
901 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  26.51 
 
 
901 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.38 
 
 
706 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>