More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  57.62 
 
 
700 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  58.76 
 
 
712 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  100 
 
 
715 aa  1407    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  88.81 
 
 
715 aa  1249    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  42.22 
 
 
705 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  39.66 
 
 
710 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  40 
 
 
725 aa  446  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  41.29 
 
 
703 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  38.21 
 
 
711 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.94 
 
 
696 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  37.09 
 
 
699 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  35.02 
 
 
708 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  35.86 
 
 
710 aa  363  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  36.03 
 
 
698 aa  357  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  36.68 
 
 
695 aa  356  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.22 
 
 
750 aa  354  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  36.72 
 
 
704 aa  353  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  37.82 
 
 
712 aa  352  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  36.25 
 
 
695 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.29 
 
 
711 aa  349  1e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.76 
 
 
697 aa  348  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  33.14 
 
 
700 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  34.97 
 
 
698 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  34.85 
 
 
711 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  37.57 
 
 
698 aa  341  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.62 
 
 
704 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  36.7 
 
 
700 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  35.32 
 
 
729 aa  333  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.51 
 
 
699 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.81 
 
 
696 aa  327  7e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  36.05 
 
 
697 aa  326  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.52 
 
 
707 aa  326  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  34.81 
 
 
897 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.79 
 
 
712 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.4 
 
 
701 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 
703 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.38 
 
 
711 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
706 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.48 
 
 
669 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.57 
 
 
741 aa  317  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  33.24 
 
 
895 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  33.15 
 
 
700 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  34.73 
 
 
697 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.88 
 
 
892 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  35.97 
 
 
705 aa  313  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.39 
 
 
718 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  33.62 
 
 
718 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  35.86 
 
 
699 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  35.38 
 
 
702 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33 
 
 
709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.87 
 
 
702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  33.38 
 
 
704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.06 
 
 
698 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  33.29 
 
 
692 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
889 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.38 
 
 
929 aa  301  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.91 
 
 
892 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.25 
 
 
699 aa  300  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  34.5 
 
 
715 aa  300  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
703 aa  299  9e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
918 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.21 
 
 
702 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  33.19 
 
 
920 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  32.13 
 
 
715 aa  296  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.61 
 
 
698 aa  296  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  32.44 
 
 
708 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  37.71 
 
 
707 aa  294  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.14 
 
 
905 aa  293  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.86 
 
 
697 aa  291  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.05 
 
 
911 aa  287  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  32.77 
 
 
711 aa  286  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.75 
 
 
706 aa  286  9e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.36 
 
 
900 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  35.93 
 
 
693 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.82 
 
 
912 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  31.11 
 
 
660 aa  282  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  32.81 
 
 
693 aa  283  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 
703 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.78 
 
 
893 aa  282  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
893 aa  280  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  34.42 
 
 
727 aa  279  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.38 
 
 
913 aa  278  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  31.93 
 
 
718 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.2 
 
 
921 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.72 
 
 
728 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.26 
 
 
915 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.45 
 
 
903 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.03 
 
 
695 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  33.2 
 
 
897 aa  270  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.23 
 
 
660 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.92 
 
 
926 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
708 aa  268  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  33.97 
 
 
699 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
702 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  32.44 
 
 
709 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.74 
 
 
911 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  33.57 
 
 
714 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  32.72 
 
 
699 aa  257  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.59 
 
 
727 aa  257  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  34.83 
 
 
716 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>