More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3975 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  61.55 
 
 		 697 aa  790    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  55.4 
 
 		 702 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  55.94 
 
 		 697 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 695 aa  1390    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  98.99 
 
 		 695 aa  1382    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  48.25 
 
 		 699 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  45.55 
 
 		 690 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 702 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  48.99 
 
 		 766 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  36.53 
 
 		 715 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.5 
 
 		 699 aa  365  1e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  35.68 
 
 		 715 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  35.09 
 
 		 711 aa  350  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  35.68 
 
 		 700 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  36.34 
 
 		 710 aa  342  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.14 
 
 		 700 aa  339  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  34.26 
 
 		 725 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.29 
 
 		 696 aa  327  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 712 aa  326  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.71 
 
 		 708 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.82 
 
 		 692 aa  321  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  33.52 
 
 		 750 aa  318  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.87 
 
 		 706 aa  313  7.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.49 
 
 		 697 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 710 aa  309  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  35.01 
 
 		 703 aa  308  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.63 
 
 		 698 aa  304  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  31.64 
 
 		 698 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.72 
 
 		 892 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.31 
 
 		 697 aa  300  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  32.09 
 
 		 711 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.76 
 
 		 741 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.02 
 
 		 911 aa  293  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  33.19 
 
 		 698 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.16 
 
 		 695 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 702 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 703 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.48 
 
 		 929 aa  286  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 700 aa  286  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.22 
 
 		 913 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.8 
 
 		 920 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 702 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.5 
 
 		 895 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  33.14 
 
 		 712 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.17 
 
 		 704 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  35.59 
 
 		 714 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 718 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 703 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.89 
 
 		 706 aa  279  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 711 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.07 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33.48 
 
 		 709 aa  275  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.01 
 
 		 918 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.08 
 
 		 700 aa  274  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 893 aa  273  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 711 aa  273  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.7 
 
 		 915 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.23 
 
 		 905 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27 
 
 		 698 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  29.68 
 
 		 897 aa  270  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  33.14 
 
 		 705 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.44 
 
 		 883 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  29.31 
 
 		 669 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.78 
 
 		 912 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 707 aa  266  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  29.72 
 
 		 707 aa  266  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 911 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.78 
 
 		 893 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  28.45 
 
 		 701 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  32.85 
 
 		 904 aa  264  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  28.15 
 
 		 696 aa  261  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.67 
 
 		 892 aa  260  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  30.91 
 
 		 729 aa  260  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.67 
 
 		 921 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.95 
 
 		 897 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 712 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 708 aa  259  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 727 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.37 
 
 		 900 aa  258  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  32.86 
 
 		 727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 693 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 		 889 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  31.12 
 
 		 703 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.03 
 
 		 904 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 704 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.04 
 
 		 715 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  32.15 
 
 		 699 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 898 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  31.42 
 
 		 705 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  32.07 
 
 		 718 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  31.68 
 
 		 852 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 		 883 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 926 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 		 893 aa  243  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 		 890 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.46 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  31.51 
 
 		 705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.37 
 
 		 711 aa  240  8e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 705 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>