More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4084 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  100 
 
 
750 aa  1499    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  35.56 
 
 
699 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.71 
 
 
696 aa  439  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 
696 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.2 
 
 
698 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.14 
 
 
697 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  36.93 
 
 
711 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.56 
 
 
711 aa  420  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  36.39 
 
 
708 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  36.38 
 
 
698 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  36.68 
 
 
712 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  35.52 
 
 
700 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.99 
 
 
699 aa  399  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  35.5 
 
 
706 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  34.55 
 
 
704 aa  398  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  35.2 
 
 
711 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  33.61 
 
 
707 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  36.98 
 
 
698 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  34.04 
 
 
669 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  32.19 
 
 
701 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  35.28 
 
 
698 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  35.11 
 
 
711 aa  386  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.09 
 
 
714 aa  383  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  35.86 
 
 
704 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.24 
 
 
892 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
702 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.63 
 
 
712 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  32.91 
 
 
703 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.82 
 
 
710 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  34.71 
 
 
700 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.92 
 
 
715 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  32.83 
 
 
702 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.8 
 
 
893 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  35.47 
 
 
703 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  37.24 
 
 
714 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
700 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  34.41 
 
 
700 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  34.87 
 
 
715 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.86 
 
 
712 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  34.14 
 
 
697 aa  366  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 
706 aa  364  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  32.34 
 
 
698 aa  364  3e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  35.8 
 
 
699 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  34.57 
 
 
704 aa  362  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  36.8 
 
 
705 aa  361  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  34.85 
 
 
703 aa  360  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  34.43 
 
 
695 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.72 
 
 
699 aa  358  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.26 
 
 
905 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.43 
 
 
911 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  35.69 
 
 
883 aa  356  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  34.23 
 
 
728 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.75 
 
 
718 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  32.68 
 
 
913 aa  355  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.27 
 
 
895 aa  353  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32.32 
 
 
892 aa  349  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
918 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.29 
 
 
929 aa  348  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.26 
 
 
692 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  33.38 
 
 
912 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.16 
 
 
921 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.03 
 
 
903 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.71 
 
 
920 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  33.52 
 
 
709 aa  332  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 
709 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.79 
 
 
889 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.24 
 
 
897 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.25 
 
 
725 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
893 aa  325  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  33.66 
 
 
695 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.75 
 
 
715 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  33.66 
 
 
695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  32.76 
 
 
697 aa  321  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  33.1 
 
 
697 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.71 
 
 
900 aa  320  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  35.04 
 
 
893 aa  320  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  34.6 
 
 
911 aa  320  7.999999999999999e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.52 
 
 
699 aa  318  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  32.72 
 
 
702 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.6 
 
 
904 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 
715 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  31.64 
 
 
911 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
727 aa  310  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  30.22 
 
 
893 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
907 aa  310  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  34.44 
 
 
898 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  31.61 
 
 
903 aa  308  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.69 
 
 
915 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
907 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  32.81 
 
 
711 aa  305  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
899 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  31.93 
 
 
741 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35.88 
 
 
904 aa  302  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  31.44 
 
 
905 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  31.33 
 
 
904 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  31.44 
 
 
901 aa  301  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  31.44 
 
 
901 aa  301  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  30.67 
 
 
708 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
907 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
899 aa  300  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>