More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1302 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  100 
 
 		 692 aa  1382    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  37.04 
 
 		 710 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  34.05 
 
 		 699 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  36.08 
 
 		 700 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.12 
 
 		 892 aa  342  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.35 
 
 		 750 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  35.04 
 
 		 712 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  34.86 
 
 		 698 aa  332  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  35.49 
 
 		 704 aa  331  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  35.01 
 
 		 700 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  34.58 
 
 		 715 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  31.14 
 
 		 702 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 918 aa  320  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  31.22 
 
 		 703 aa  320  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.67 
 
 		 911 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 695 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  31.14 
 
 		 702 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.28 
 
 		 895 aa  317  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  33.43 
 
 		 715 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  34.91 
 
 		 695 aa  317  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.57 
 
 		 703 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 712 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  34.88 
 
 		 718 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.65 
 
 		 929 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 706 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  32.96 
 
 		 700 aa  310  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.24 
 
 		 905 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.16 
 
 		 711 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.2 
 
 		 921 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.59 
 
 		 697 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  33.77 
 
 		 697 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 669 aa  304  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 710 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.87 
 
 		 696 aa  301  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 711 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  32.66 
 
 		 697 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  33.15 
 
 		 711 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31 
 
 		 696 aa  297  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 706 aa  297  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.92 
 
 		 714 aa  296  8e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  33.48 
 
 		 709 aa  296  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.8 
 
 		 920 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.88 
 
 		 741 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.7 
 
 		 707 aa  293  8e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.6 
 
 		 912 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.72 
 
 		 708 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.5 
 
 		 699 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 711 aa  290  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  31.16 
 
 		 708 aa  289  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.91 
 
 		 883 aa  290  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 718 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  32.48 
 
 		 702 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.53 
 
 		 897 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  30.99 
 
 		 700 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.26 
 
 		 699 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  29.99 
 
 		 712 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 704 aa  282  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.06 
 
 		 915 aa  282  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.54 
 
 		 698 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.38 
 
 		 728 aa  280  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 718 aa  280  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  33.24 
 
 		 725 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  34.7 
 
 		 705 aa  279  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.93 
 
 		 698 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.17 
 
 		 900 aa  277  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.45 
 
 		 697 aa  277  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  34.71 
 
 		 714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 		 715 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 701 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 893 aa  273  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 699 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  30.63 
 
 		 711 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 911 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  33.58 
 
 		 690 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  31.88 
 
 		 709 aa  271  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.87 
 
 		 704 aa  270  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 703 aa  270  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.62 
 
 		 889 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 702 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  30.74 
 
 		 698 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.46 
 
 		 695 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  34.05 
 
 		 705 aa  263  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.15 
 
 		 892 aa  262  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  34.47 
 
 		 716 aa  262  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 729 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 697 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 		 883 aa  261  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  36.68 
 
 		 707 aa  260  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  32.02 
 
 		 715 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.82 
 
 		 913 aa  258  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.08 
 
 		 660 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 660 aa  255  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.27 
 
 		 890 aa  253  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  30.1 
 
 		 903 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  30.94 
 
 		 727 aa  250  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  29.55 
 
 		 685 aa  250  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  33.61 
 
 		 696 aa  250  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  33.24 
 
 		 696 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  28.59 
 
 		 904 aa  248  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>