More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0674 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  100 
 
 
705 aa  1395    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  60.63 
 
 
707 aa  730    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  62.26 
 
 
729 aa  840    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  42.98 
 
 
741 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  40.2 
 
 
718 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 
706 aa  350  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  36.15 
 
 
715 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  34.1 
 
 
669 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  35.46 
 
 
715 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.94 
 
 
696 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
718 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  33.71 
 
 
700 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  34.54 
 
 
711 aa  325  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.18 
 
 
710 aa  324  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 
698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.29 
 
 
698 aa  321  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.78 
 
 
708 aa  316  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.87 
 
 
929 aa  316  7e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  34.08 
 
 
700 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  35.07 
 
 
710 aa  314  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.59 
 
 
711 aa  313  9e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.96 
 
 
728 aa  310  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.76 
 
 
711 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.81 
 
 
920 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.66 
 
 
912 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.52 
 
 
883 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.76 
 
 
921 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  32.05 
 
 
699 aa  299  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  33.74 
 
 
725 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.42 
 
 
911 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.64 
 
 
712 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.22 
 
 
714 aa  296  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  30.92 
 
 
702 aa  296  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.89 
 
 
750 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
918 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
702 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.08 
 
 
697 aa  295  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
703 aa  295  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.11 
 
 
699 aa  292  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.28 
 
 
915 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  32.13 
 
 
711 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.64 
 
 
701 aa  291  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.7 
 
 
692 aa  290  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.44 
 
 
706 aa  288  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
704 aa  286  9e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.59 
 
 
715 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.87 
 
 
897 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.96 
 
 
892 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.37 
 
 
712 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.72 
 
 
700 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  29.36 
 
 
696 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  30.56 
 
 
698 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.92 
 
 
905 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.54 
 
 
900 aa  281  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  33.53 
 
 
904 aa  280  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  32.9 
 
 
709 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
711 aa  279  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  34.33 
 
 
716 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  33.05 
 
 
695 aa  278  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  34.03 
 
 
703 aa  277  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  29.67 
 
 
707 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 
695 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.91 
 
 
892 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  33.7 
 
 
712 aa  272  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  31.1 
 
 
893 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  33.1 
 
 
897 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  31.42 
 
 
697 aa  262  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.07 
 
 
704 aa  261  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.01 
 
 
895 aa  259  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.1 
 
 
699 aa  259  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 
703 aa  258  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  32.23 
 
 
698 aa  257  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
889 aa  254  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  30.74 
 
 
708 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.21 
 
 
704 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
700 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.74 
 
 
702 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.13 
 
 
727 aa  253  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.02 
 
 
697 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.21 
 
 
698 aa  251  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
705 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  31.2 
 
 
705 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
926 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  28.97 
 
 
685 aa  249  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
893 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  31.36 
 
 
690 aa  246  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  29.09 
 
 
684 aa  246  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  32.24 
 
 
697 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  30.59 
 
 
697 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.76 
 
 
913 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  28.88 
 
 
695 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.56 
 
 
890 aa  241  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  30.79 
 
 
718 aa  241  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.9 
 
 
907 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  30 
 
 
898 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  30.2 
 
 
709 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  31.27 
 
 
715 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 
705 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  33.8 
 
 
699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  31.86 
 
 
705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>