More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3916 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  71.91 
 
 		 725 aa  951    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 703 aa  1377    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  42.74 
 
 		 715 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  41.43 
 
 		 715 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  40.45 
 
 		 700 aa  436  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  39.94 
 
 		 712 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  38.47 
 
 		 710 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  38.49 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  37.24 
 
 		 700 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  35.78 
 
 		 704 aa  369  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.6 
 
 		 750 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.68 
 
 		 711 aa  359  9e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  37.43 
 
 		 711 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  34.32 
 
 		 669 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 701 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.44 
 
 		 696 aa  342  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.27 
 
 		 698 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.65 
 
 		 707 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.56 
 
 		 697 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.7 
 
 		 706 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  36.17 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 702 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  32.56 
 
 		 905 aa  326  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.01 
 
 		 699 aa  325  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  33.2 
 
 		 889 aa  323  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  34.29 
 
 		 892 aa  323  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 703 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 709 aa  320  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.83 
 
 		 897 aa  320  7e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 702 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  32.14 
 
 		 711 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  34.41 
 
 		 697 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  35.61 
 
 		 695 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 		 893 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.87 
 
 		 704 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 712 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  34.42 
 
 		 711 aa  312  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 698 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  35.81 
 
 		 712 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 695 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 706 aa  310  4e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.29 
 
 		 892 aa  310  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  32.46 
 
 		 895 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  33.43 
 
 		 702 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.83 
 
 		 929 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  33.61 
 
 		 708 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  36.36 
 
 		 698 aa  306  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 718 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 893 aa  302  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 700 aa  300  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 710 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  34.06 
 
 		 700 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 660 aa  298  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.37 
 
 		 900 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  33.15 
 
 		 913 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  35.71 
 
 		 897 aa  296  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  34.58 
 
 		 715 aa  296  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.01 
 
 		 918 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.15 
 
 		 714 aa  294  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.22 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.39 
 
 		 696 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  36.25 
 
 		 699 aa  290  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.05 
 
 		 698 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.48 
 
 		 715 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.36 
 
 		 920 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.96 
 
 		 711 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.38 
 
 		 911 aa  284  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  33.57 
 
 		 718 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.98 
 
 		 703 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.73 
 
 		 921 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.66 
 
 		 904 aa  273  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  30.11 
 
 		 912 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.87 
 
 		 699 aa  272  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.64 
 
 		 697 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  33.7 
 
 		 704 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  33.05 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  35.19 
 
 		 716 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 727 aa  267  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  32.13 
 
 		 903 aa  267  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  34.2 
 
 		 699 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.98 
 
 		 728 aa  265  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  34.03 
 
 		 705 aa  263  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  35.26 
 
 		 714 aa  263  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.78 
 
 		 915 aa  261  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  29.31 
 
 		 682 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 729 aa  257  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  34.62 
 
 		 904 aa  257  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  31.86 
 
 		 708 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.55 
 
 		 741 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.92 
 
 		 695 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.93 
 
 		 883 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 		 727 aa  249  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  31.99 
 
 		 718 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 904 aa  247  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  32.22 
 
 		 709 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  32.78 
 
 		 699 aa  247  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 702 aa  247  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>